108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01180 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01180  Rossman fold oxidoreductase, putative  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05700  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.328433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.53 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175261  normal  0.299031 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40154  predicted protein  28.42 
 
 		 282 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.529098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 242 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 258 aa  97.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 229 aa  96.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12043  predicted protein  28.96 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1301  C factor cell-cell signaling protein  31.25 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.37 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.210939  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  29.46 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4061  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.85 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  26.37 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 		 256 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 		 221 aa  89  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3642  CsgA, Rossman fold oxidoreductase  27.45 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 		 244 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.329508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 233 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.324723  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  31.17 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.77001  hitchhiker  0.00492189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0074  C factor cell-cell signaling protein  27.72 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0395  putative short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.518242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  28.22 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0516  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.94 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.567639  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1127  CsgA C-factor signaling protein  28.25 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.596754  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  32.19 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0409  putative short chain dehydrogenase  28.5 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04331  putative short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0667  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.69 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04751  putative short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04641  putative short chain dehydrogenase  30.68 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.139782  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.325747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  26.35 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.97 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4369  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.949414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0120  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.67 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0930  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  38.39 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3165  hypothetical protein  39.29 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1351  CsgA C-factor signaling protein  29.95 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2109  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  24.23 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334946  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3527  C factor cell-cell signaling protein  26.13 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0523  C factor cell-cell signaling protein  25.35 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4170  C factor cell-cell signaling protein  25.63 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3705  C factor cell-cell signaling protein  25.44 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1495  hypothetical protein  27.76 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0535918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2496  C factor cell-cell signaling protein  53.23 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  29.31 
 
 		 235 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0428  C factor cell-cell signaling protein  37.27 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1411  C factor cell-cell signaling protein  33.33 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  25.42 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0440  C factor cell-cell signaling protein  25 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  25.42 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  25 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.01 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06691  C factor cell-cell signaling protein  25.61 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  24.31 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.73 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.07 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  43.08 
 
 		 193 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.26 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  26.79 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  24.57 
 
 		 221 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  23.81 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  41.54 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  24.37 
 
 		 224 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  28.89 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.86 
 
 		 228 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  28.24 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  33.61 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  28.32 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.7 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>