More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2144 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.34 
 
 
223 aa  334  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
223 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  50.67 
 
 
219 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.22 
 
 
221 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  48.2 
 
 
221 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  48.2 
 
 
224 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  48.65 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  48.88 
 
 
221 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  48.42 
 
 
221 aa  191  6e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
223 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  44.59 
 
 
221 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  46.4 
 
 
221 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  44.59 
 
 
221 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  44.14 
 
 
221 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  43.95 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.78 
 
 
230 aa  180  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  48.42 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
233 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
231 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 
232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
228 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  38.75 
 
 
253 aa  123  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.8 
 
 
232 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 
229 aa  122  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  38.14 
 
 
231 aa  121  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
235 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.27 
 
 
228 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  37.61 
 
 
247 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
228 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
231 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  38.57 
 
 
237 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
233 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  35.62 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  35.05 
 
 
221 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  37.12 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 
236 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
225 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
225 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
225 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  37.72 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
225 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 
222 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 
225 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 
225 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
229 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00830  cytoplasm protein, putative  30.38 
 
 
260 aa  105  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
228 aa  104  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
231 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
214 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
213 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
217 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  36.84 
 
 
193 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
229 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  34.96 
 
 
225 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  33.63 
 
 
234 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
226 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
226 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
225 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
231 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  36.17 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
241 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.12 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4367  short chain dehydrogenase  37.38 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  32.46 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5986  short chain dehydrogenase  33.8 
 
 
220 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0578  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0395  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 
228 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
248 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
166 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
260 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0416  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3084  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2276  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2011  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>