More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1893 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.64 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.72 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  44.87 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.87 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  44.21 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 231 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  41.92 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.83 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  46.81 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  39.66 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  42.98 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  42.67 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  41.88 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  38.36 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  42.17 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  41.2 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  38.3 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  38.89 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  39.32 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  37.07 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  39.06 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 		 221 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  38.46 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  42.98 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2084  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0860576  normal  0.320515 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 		 226 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.61 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.64 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  39.39 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  38.3 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  37.28 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  35.15 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12179  normal  0.661706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.819367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  36.91 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  31.58 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  35.06 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40154  predicted protein  31.44 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.529098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.18 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>