More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03037 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  396  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  84.97 
 
 		 229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.86 
 
 		 231 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  62.05 
 
 		 231 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.36 
 
 		 231 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.92 
 
 		 231 aa  207  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.58 
 
 		 232 aa  191  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  53.85 
 
 		 229 aa  190  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.78 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  50.26 
 
 		 231 aa  174  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.03 
 
 		 227 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  42.78 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 		 232 aa  147  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.81 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.56 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  41.97 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.05 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 229 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  37 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  39.47 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  41.4 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  40 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  36.27 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  41.49 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  35.75 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  38.95 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  42.33 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  42.33 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  37.5 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 256 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  39.39 
 
 		 229 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 225 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  39.04 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  39.69 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  38.42 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  38.1 
 
 		 221 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  35.2 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  40.11 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.2 
 
 		 241 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 228 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 238 aa  104  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  35.23 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  33.98 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  34.36 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 239 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2084  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 238 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0860576  normal  0.320515 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  39.09 
 
 		 253 aa  98.2  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01300  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase (JCVI)  36.74 
 
 		 260 aa  97.8  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 258 aa  97.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 228 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 238 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0578  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>