More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3190 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 217 aa  440  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 		 213 aa  228  5e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  52.23 
 
 		 221 aa  225  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  37.78 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  37.17 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.17 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  35.09 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  37.89 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  33.76 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  36.77 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  37.33 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  33.93 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  36.77 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  34.98 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 235 aa  104  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  33.05 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  37.39 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  35.4 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.07 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 223 aa  98.6  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.93 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  35.82 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  32.89 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  32.59 
 
 		 221 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  32.14 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  31.7 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5986  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  32.16 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000616439 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  29.13 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  29.53 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.84 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  32.9 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.105018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 239 aa  78.2  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.03 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1941  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0923131  normal  0.859754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>