More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_07571 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  97.29 
 
 		 221 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  95.02 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  76.92 
 
 		 221 aa  358  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  68.78 
 
 		 221 aa  321  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  64.71 
 
 		 221 aa  297  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  64.25 
 
 		 224 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  62.44 
 
 		 221 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.09 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  57.92 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  55.66 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 		 223 aa  228  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  47.93 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  46.64 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  44.7 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.97 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  39.66 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 		 231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  36.68 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  33.62 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  34.89 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  36.94 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 206 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  32.39 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  38.95 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  35.64 
 
 		 193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.62 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00830  cytoplasm protein, putative  31.3 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  31.76 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  31.64 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  32 
 
 		 255 aa  103  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  30.9 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 		 237 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  32.88 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03161  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G13450)  29 
 
 		 257 aa  95.5  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.560163  normal  0.771081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  33.33 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.325747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  28.45 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11130  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 236 aa  91.7  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  31.36 
 
 		 259 aa  91.3  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  28.33 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  26.23 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0440  C factor cell-cell signaling protein  29.36 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  29.36 
 
 		 235 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>