More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4186 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  100 
 
 
222 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3775  short chain dehydrogenase  67.12 
 
 
222 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3053  short chain dehydrogenase  66.22 
 
 
222 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4367  short chain dehydrogenase  64.38 
 
 
228 aa  255  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5986  short chain dehydrogenase  55.3 
 
 
220 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  52.94 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  51.56 
 
 
226 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  48.46 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  48.87 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 
225 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
225 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0377  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 
225 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.773672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  49.11 
 
 
236 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
225 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
225 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 
225 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2977  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 
225 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  46.26 
 
 
237 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2840  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal  0.858614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 
225 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0343  short chain dehydrogenase  47.51 
 
 
225 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0578  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
225 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0395  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
225 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0416  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 
225 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
233 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2276  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2011  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3084  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0097  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 
227 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  38.39 
 
 
234 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
231 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
223 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  33.63 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
233 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
217 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  33.19 
 
 
247 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
231 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
228 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  37.33 
 
 
234 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 
232 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 
227 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  37.12 
 
 
231 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.63 
 
 
232 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2084  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
238 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0860576  normal  0.320515 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
231 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
228 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  33.64 
 
 
221 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
232 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  32.74 
 
 
226 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
214 aa  101  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
239 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4004  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
239 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.819367  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
228 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  33.03 
 
 
226 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
223 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  33.78 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12179  normal  0.661706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
231 aa  99  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
238 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460296  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
237 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  32.88 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  36.46 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.56 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.562749 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  32.88 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
228 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.506179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  35.14 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  30.67 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  34.63 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
206 aa  89.4  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 
238 aa  88.6  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 
256 aa  87  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
239 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
255 aa  86.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
233 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0637  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000253756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
237 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>