More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1087 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 
221 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  69.68 
 
 
221 aa  311  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  67.87 
 
 
221 aa  309  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.16 
 
 
221 aa  292  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  59.73 
 
 
221 aa  287  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  55.66 
 
 
221 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  55.66 
 
 
221 aa  265  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  56.11 
 
 
221 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  56.56 
 
 
221 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  56.11 
 
 
224 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  52.94 
 
 
221 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.46 
 
 
223 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 
223 aa  217  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  50.69 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.68 
 
 
223 aa  203  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.09 
 
 
230 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.42 
 
 
223 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  45.87 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 
232 aa  158  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
231 aa  144  9e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
233 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
231 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  39.39 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
231 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  39.17 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  39.48 
 
 
231 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
231 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
227 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  35.37 
 
 
247 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  36.8 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.75 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  36.75 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
231 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  37.5 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  37.39 
 
 
226 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  37 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  37.23 
 
 
193 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
214 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  39.25 
 
 
193 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 
226 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
256 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  29.66 
 
 
241 aa  101  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
237 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
258 aa  99  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
235 aa  98.6  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
237 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00830  cytoplasm protein, putative  30.4 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33463  short-chain alcohol dehydrogenase with NAD or NADP as acceptor  35.29 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
256 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0409  putative short chain dehydrogenase  31.36 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
254 aa  94  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  33.74 
 
 
256 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  31.74 
 
 
264 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.61 
 
 
217 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.325387 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03161  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family superfamily (AFU_orthologue; AFUA_3G13450)  30.04 
 
 
257 aa  92.8  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.560163  normal  0.771081 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
233 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  29.73 
 
 
226 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 
231 aa  92  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  29.66 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40154  predicted protein  29.77 
 
 
282 aa  89.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.529098  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04331  putative short chain dehydrogenase  29.66 
 
 
234 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04641  putative short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.139782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
243 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320432  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
228 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  29.96 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
217 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.325747  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0232972  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
231 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
228 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04751  putative short chain dehydrogenase  30.53 
 
 
234 aa  85.1  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  32.29 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0523  C factor cell-cell signaling protein  27.35 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.210939  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  29.36 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>