More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000794 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  100 
 
 		 235 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06691  C factor cell-cell signaling protein  88.24 
 
 		 235 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  62.55 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3527  C factor cell-cell signaling protein  61.86 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1411  C factor cell-cell signaling protein  67.57 
 
 		 235 aa  315  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  62.55 
 
 		 235 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0440  C factor cell-cell signaling protein  62.55 
 
 		 235 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0523  C factor cell-cell signaling protein  61.7 
 
 		 235 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0428  C factor cell-cell signaling protein  61.44 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3705  C factor cell-cell signaling protein  61.86 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  62.13 
 
 		 235 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4170  C factor cell-cell signaling protein  61.02 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2496  C factor cell-cell signaling protein  60.08 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1495  hypothetical protein  47.88 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0535918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0074  C factor cell-cell signaling protein  44.67 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1301  C factor cell-cell signaling protein  47 
 
 		 263 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  47 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.324723  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  49.12 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1127  CsgA C-factor signaling protein  39.66 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.596754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.98 
 
 		 244 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1351  CsgA C-factor signaling protein  41 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  40.49 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0395  putative short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.518242  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10851  hypothetical protein  37.97 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.77001  hitchhiker  0.00492189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0516  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.567639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04331  putative short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0120  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0409  putative short chain dehydrogenase  36.71 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2109  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  38.46 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334946  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04751  putative short chain dehydrogenase  37.71 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04641  putative short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.139782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0667  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  40.82 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  37.08 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4369  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.949414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.51 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.210939  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175261  normal  0.299031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12043  predicted protein  34.48 
 
 		 260 aa  138  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  33.05 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.329508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4061  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.73 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3165  hypothetical protein  39.58 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  35.17 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0930  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  40.74 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40154  predicted protein  32.32 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.529098  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.325747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  38.83 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3642  CsgA, Rossman fold oxidoreductase  31.22 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  35.2 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  32.35 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  32.77 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  32.77 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  30.9 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 223 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  30.9 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  29.17 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  29.49 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  28 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  30.47 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.6 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  30.99 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  29.67 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  28.05 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  31.36 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.36 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  29.03 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.87 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  26.14 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>