163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_10851 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_10851  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.77001  hitchhiker  0.00492189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0395  putative short chain dehydrogenase  98.33 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.518242  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1127  CsgA C-factor signaling protein  54.7 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.596754  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0409  putative short chain dehydrogenase  54.31 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04641  putative short chain dehydrogenase  53.45 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.139782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04331  putative short chain dehydrogenase  53.02 
 
 		 234 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04751  putative short chain dehydrogenase  53.88 
 
 		 234 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1351  CsgA C-factor signaling protein  50.85 
 
 		 242 aa  252  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  51.79 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0428  C factor cell-cell signaling protein  41 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0523  C factor cell-cell signaling protein  41.77 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3527  C factor cell-cell signaling protein  41 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0120  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.44 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3705  C factor cell-cell signaling protein  40.17 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  41.35 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4170  C factor cell-cell signaling protein  40.59 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  40.93 
 
 		 235 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  43.46 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0440  C factor cell-cell signaling protein  40.93 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  40.93 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.99 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0667  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  47.4 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1301  C factor cell-cell signaling protein  41.62 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06691  C factor cell-cell signaling protein  43.48 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  37.97 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0074  C factor cell-cell signaling protein  37.45 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175261  normal  0.299031 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  40.61 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1495  hypothetical protein  42.7 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0535918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.11 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.324723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1411  C factor cell-cell signaling protein  46.67 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2496  C factor cell-cell signaling protein  47.06 
 
 		 238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.79 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.210939  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  37.24 
 
 		 241 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4369  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 251 aa  144  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.949414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  37.66 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  34.47 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.62 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.325747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4061  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.69 
 
 		 253 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185996  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0516  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.08 
 
 		 244 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.567639  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  38.02 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.329508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0930  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  37.56 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12043  predicted protein  38.16 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3165  hypothetical protein  43.12 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2109  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  32.41 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334946  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40154  predicted protein  37.29 
 
 		 282 aa  122  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.529098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 221 aa  121  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3642  CsgA, Rossman fold oxidoreductase  30.3 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01180  Rossman fold oxidoreductase, putative  33.33 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  28.05 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05700  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.328433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  27.64 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  24.75 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.43 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  25.61 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.26 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.85 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  25.11 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  26.42 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.14 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  29.57 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  28.18 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  29.83 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.7 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  32.61 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  26.34 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  29.73 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.34 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  29.73 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  25.13 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.7 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 		 237 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  27.21 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>