214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0598 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.84 
 
 		 217 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.325387 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3424  hypothetical protein  61.47 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3708  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.34 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.325747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3642  CsgA, Rossman fold oxidoreductase  53.88 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0083  C factor  52.02 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.58 
 
 		 234 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7188  putative glucose/ribitol dehydrogenase  50.75 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175261  normal  0.299031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.34 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4369  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.949414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.51 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.329508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.324723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.210939  normal  0.103918 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04641  putative short chain dehydrogenase  36.67 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.139782  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04331  putative short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1351  CsgA C-factor signaling protein  40.52 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.430394 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0409  putative short chain dehydrogenase  36.25 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0074  C factor cell-cell signaling protein  33.88 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4170  C factor cell-cell signaling protein  38.46 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1127  CsgA C-factor signaling protein  38.53 
 
 		 242 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.596754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3527  C factor cell-cell signaling protein  38.3 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1118  C factor cell-cell signaling protein  37.76 
 
 		 259 aa  141  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04751  putative short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1301  C factor cell-cell signaling protein  38.27 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.71 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0523  C factor cell-cell signaling protein  34.76 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0440  C factor cell-cell signaling protein  34.04 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 248 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3873  C factor cell-cell signaling protein  34.89 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3970  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 256 aa  138  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000119913  decreased coverage  0.00103281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00155018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0466  C factor cell-cell signaling protein  35.32 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0428  C factor cell-cell signaling protein  37.87 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3705  C factor cell-cell signaling protein  38.56 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.69 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0457  C factor cell-cell signaling protein  34.47 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03636  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  35.92 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246288  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10851  hypothetical protein  32.9 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.77001  hitchhiker  0.00492189 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0516  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.93 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.567639  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0395  putative short chain dehydrogenase  32.47 
 
 		 239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.518242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2109  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  33.6 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334946  normal  0.249661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0667  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.61 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4061  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.14 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2727  C-factor, putative  43.03 
 
 		 256 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1411  C factor cell-cell signaling protein  38.74 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0120  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.543229  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40154  predicted protein  32.57 
 
 		 282 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.529098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3165  hypothetical protein  38.51 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2496  C factor cell-cell signaling protein  38.83 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000794  cell-cell signaling protein C-factor  31.76 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0930  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  32.94 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06691  C factor cell-cell signaling protein  33.33 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05700  conserved hypothetical protein  37.43 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.328433 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12043  predicted protein  31.17 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1495  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0535918  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01180  Rossman fold oxidoreductase, putative  30.89 
 
 		 290 aa  93.2  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  29.44 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  30.13 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  26.2 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  30.13 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  26.2 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  24.89 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  31.6 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  32.43 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  30.74 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  30 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  25.31 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  26.18 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.51 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  29.74 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  29.06 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  30.41 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  28.94 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.74 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>