More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36622 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  46.75 
 
 
255 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
256 aa  203  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54817  putative short chain dehydrogenase  44 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176178  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
233 aa  131  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  33.73 
 
 
231 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
232 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
229 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  32.79 
 
 
221 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  32.39 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  33.6 
 
 
221 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  32.79 
 
 
221 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  37.5 
 
 
193 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  31.6 
 
 
234 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  30.65 
 
 
247 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
214 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 
231 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  31.98 
 
 
224 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  31.98 
 
 
221 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 
232 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
231 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.92 
 
 
232 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
206 aa  102  5e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
233 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
231 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14521  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  29.15 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00861762 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01300  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase (JCVI)  30.74 
 
 
260 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
235 aa  94  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
227 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06659  short chain dehydrogenase (AtsC), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00180)  33.78 
 
 
273 aa  92.4  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
221 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.77 
 
 
221 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  28.23 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 
237 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
228 aa  89  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12043  predicted protein  26.59 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0975  short-chain dehydrogenase/reductase  29.6 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.264766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5935  FixR protein  30.81 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  27.6 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  29.64 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
258 aa  82  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
246 aa  82  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  28.51 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1022  short chain dehydrogenase  28.23 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  29.05 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0113  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.81 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0116  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.81 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  26 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  26.09 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  25.91 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  29.27 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  32.55 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.56 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.5 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3437  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  30 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3196  short chain dehydrogenase  28 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.2 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  30 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3218  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.5 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3471  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.5 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  25.5 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.82 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01434  Short chain dehydrogenase family protein  29.02 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>