More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3826 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3826  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.753921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3823  transcriptional regulator, AraC family  68.28 
 
 		 309 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5642  transcriptional regulator, AraC family  68.83 
 
 		 308 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0009  helix-turn-helix- domain containing protein  37.79 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29140  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  32.69 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1518  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 180 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1714  AraC-type transcriptional regulator-like protein  31.68 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.19 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.19 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  26.67 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  23.19 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  33.98 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0990  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 779 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.74 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 766 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.29 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  32.97 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1236  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000472369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  23.48 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  32 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  23.02 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.2 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.33 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.26 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3116  helix-turn-helix domain-containing protein  27.95 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 522 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.98 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.52 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  36.14 
 
 		 1344 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 1201 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.98 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  30.93 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  33.98 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3411  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3418  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  27.05 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  30 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0074  transcriptional regulator, AraC family protein  33.33 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5242  helix-turn-helix domain-containing protein  25.31 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>