215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4500 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  72.92 
 
 		 479 aa  662    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5408  outer membrane porin  65.88 
 
 		 490 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0356  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 480 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1248  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 486 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4433  outer membrane porin  67.63 
 
 		 529 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0120  outer membrane porin  72.5 
 
 		 474 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00350083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2214  OprD family outer membrane porin  70.6 
 
 		 501 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0752  outer membrane porin for cationic amino acids and peptides  67.4 
 
 		 499 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5323  outer membrane porin  67.34 
 
 		 478 aa  670    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4861  outer membrane porin  71.98 
 
 		 478 aa  670    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.054091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4735  outer membrane porin  73.04 
 
 		 478 aa  668    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5537  outer membrane porin  67.34 
 
 		 478 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00176042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1539  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 486 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1729  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 486 aa  647    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3014  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 527 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0532717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2898  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 527 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0390  OprD family outer membrane porin  70.52 
 
 		 527 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4500  outer membrane porin  100 
 
 		 505 aa  1037    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697186  normal  0.197989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  35.19 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  35.53 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  35.75 
 
 		 478 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  34.92 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  33.95 
 
 		 459 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  32.15 
 
 		 471 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  34.49 
 
 		 459 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  34.26 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  33.33 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  33.58 
 
 		 447 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  34.79 
 
 		 448 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  32.28 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  32.66 
 
 		 441 aa  193  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  31.32 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  33.18 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  30.23 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  31.02 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  31.65 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  31.01 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  31.48 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  31.48 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  31.57 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  32.8 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  31.19 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  31.65 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  31.42 
 
 		 444 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  31.6 
 
 		 431 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  30.41 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  28.7 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  28.67 
 
 		 441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  34.41 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  29.2 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  29.91 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  29.91 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  29.91 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  29.91 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  34.41 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  32.18 
 
 		 420 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  31.24 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  29.89 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  31.03 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  32 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  31.75 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  28.86 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  30.89 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  32.7 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  29.16 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  32.46 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  28.93 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  28.94 
 
 		 452 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  28.15 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  29.72 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  27.51 
 
 		 425 aa  146  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  30.84 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  29.17 
 
 		 452 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  31.4 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  31.24 
 
 		 444 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  29.88 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  31.22 
 
 		 439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  30.59 
 
 		 424 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  29.95 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  30.84 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  30.84 
 
 		 412 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  28.81 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  30.6 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  31.08 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  29.65 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  30.14 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  29.65 
 
 		 439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  29.93 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  29.26 
 
 		 416 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  30.14 
 
 		 479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  29.33 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  30.14 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  30.71 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  28.78 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  29.5 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  29.26 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  29.63 
 
 		 422 aa  131  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  29.11 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  28.7 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  28.64 
 
 		 418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>