217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3618 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0046  porin, putative  76.02 
 
 		 447 aa  705    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  76.02 
 
 		 447 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  76.57 
 
 		 447 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  74.38 
 
 		 441 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  70.29 
 
 		 441 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  78.37 
 
 		 447 aa  687    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  74.6 
 
 		 441 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  100 
 
 		 441 aa  902    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  76.02 
 
 		 447 aa  705    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  77.03 
 
 		 447 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  73.02 
 
 		 440 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  76.02 
 
 		 447 aa  705    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  69.28 
 
 		 446 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  60.85 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  60.27 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  44.86 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  44.99 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  44.32 
 
 		 479 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  43.71 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  43.08 
 
 		 443 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  42.6 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  43.18 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  42.51 
 
 		 421 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  42.95 
 
 		 422 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  42.79 
 
 		 444 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  42.32 
 
 		 444 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  42.3 
 
 		 444 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  42.79 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  43.26 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  42.79 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  42.12 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  42.17 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  43.95 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  41.72 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  41.74 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  41.15 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  42.23 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.82 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  36.89 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  38.04 
 
 		 431 aa  279  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  36.66 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  39.38 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  40.48 
 
 		 414 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  38.55 
 
 		 427 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  38.55 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  35.2 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  36.63 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  39.07 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  37.26 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  35.99 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  35.62 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  38.89 
 
 		 409 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  36.14 
 
 		 467 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  37.23 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  35.41 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  36.56 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  34.98 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  36.56 
 
 		 429 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  36.32 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  36.57 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  35.75 
 
 		 429 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.75 
 
 		 421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.75 
 
 		 421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.9 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  34.53 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  35.15 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  35.35 
 
 		 433 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  36.36 
 
 		 452 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  36.79 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  36.03 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  33.47 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  37.02 
 
 		 416 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  37.35 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38 
 
 		 429 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  37.97 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.62 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  36.82 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  35.81 
 
 		 425 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  34.7 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  34.52 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  34.58 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  36.38 
 
 		 431 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  34.16 
 
 		 417 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  36.08 
 
 		 431 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  33.33 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  32.4 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  34.22 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  32.63 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  33.86 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.57 
 
 		 413 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  34.74 
 
 		 428 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  34.47 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  33.41 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  35.99 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  35.85 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  32.96 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  35.64 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  33.79 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  34.22 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  33.56 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>