223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5621 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  100 
 
 		 417 aa  846    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  97.12 
 
 		 417 aa  830    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  72.05 
 
 		 417 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  72.75 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  53.77 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  53.98 
 
 		 421 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  51.99 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  52.61 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  52.36 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  52.11 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  52.36 
 
 		 415 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  52.78 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  52.2 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  51.86 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  50.6 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  51.11 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  51.42 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  47.48 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  52.36 
 
 		 416 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  50.61 
 
 		 422 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  49.88 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  50.13 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  49.62 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  49.62 
 
 		 412 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  48.17 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  48.62 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  46.36 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  50.13 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  50.86 
 
 		 416 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  50.62 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  49.11 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  47.77 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  46.79 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  47.07 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  46.08 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  46.98 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  45.84 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  45.9 
 
 		 422 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  47.33 
 
 		 416 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  46.56 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  46.56 
 
 		 416 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  46.56 
 
 		 416 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  46.32 
 
 		 413 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  47.57 
 
 		 429 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  43.61 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  43.51 
 
 		 428 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  45.36 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  45.11 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  44.86 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  43.94 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  44.31 
 
 		 421 aa  325  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  43.47 
 
 		 427 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  44.79 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  40.48 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  40.48 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  43.11 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.34 
 
 		 422 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  44.07 
 
 		 429 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  44.31 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  42.23 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  43.13 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  42.86 
 
 		 416 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  42.37 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.02 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  41.55 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  41.99 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  40.48 
 
 		 418 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  40.78 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  40.82 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  39.9 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  41.11 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  40.92 
 
 		 418 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  42.44 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  42.3 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  39.42 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  40.94 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  40.94 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  38.35 
 
 		 412 aa  272  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.93 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  38.95 
 
 		 424 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  38.37 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  38.06 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  37.01 
 
 		 417 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  37.01 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  39.35 
 
 		 440 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.28 
 
 		 420 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  38.26 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.04 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  37.65 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  38.31 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  38.06 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  36.63 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  36.98 
 
 		 430 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  38.31 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  37.15 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  37.16 
 
 		 427 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  35.5 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  35.51 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  35.76 
 
 		 427 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  36.11 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>