237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4394 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  94.59 
 
 		 444 aa  848    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  94.59 
 
 		 444 aa  848    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  94.59 
 
 		 444 aa  849    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  100 
 
 		 444 aa  914    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  66.74 
 
 		 438 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  60.71 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  60.71 
 
 		 444 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  44.01 
 
 		 467 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  44.93 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  42.17 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  41.13 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  41.13 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  41.13 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  41.13 
 
 		 447 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  41.72 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  41.78 
 
 		 440 aa  326  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  40.49 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  40.23 
 
 		 447 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  38.33 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  40.95 
 
 		 447 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  40.5 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  37.67 
 
 		 441 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  38.6 
 
 		 449 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  38.58 
 
 		 479 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  39.78 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  40.09 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  41.34 
 
 		 441 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  37.31 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  39.82 
 
 		 448 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  40.97 
 
 		 443 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  37.36 
 
 		 435 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  38.18 
 
 		 454 aa  269  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.85 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  37.67 
 
 		 435 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  36.88 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  36.03 
 
 		 445 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  38.11 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  35.4 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  35.55 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  37.39 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  35.76 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  37.22 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  36.38 
 
 		 420 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  37.1 
 
 		 421 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  37.1 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  36.38 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  36.47 
 
 		 420 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  36.47 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  35.16 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  35.46 
 
 		 427 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.29 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.29 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  36.38 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  33.95 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.52 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  34.68 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  33.03 
 
 		 417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  33.11 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  35.71 
 
 		 416 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  33.94 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  34.66 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  34.31 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  32.43 
 
 		 416 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  32.51 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  34.38 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  34.37 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  35.02 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.81 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  35.49 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  35.14 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  32.35 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  32.51 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  34.5 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  34.19 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  33.97 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  33.26 
 
 		 426 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  33.85 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.33 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.21 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  33.48 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  34.8 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  34.8 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  33.63 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  32.93 
 
 		 418 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  33.73 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  33.33 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  31.85 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  31.75 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  33.73 
 
 		 429 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  34.58 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  33.57 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  33.57 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  32.21 
 
 		 416 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  30.93 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  32.65 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  32.65 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  33.33 
 
 		 416 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  30.65 
 
 		 420 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  31.94 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.33 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>