225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_36090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  96.88 
 
 		 416 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  100 
 
 		 416 aa  832    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  51.8 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  52.04 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  52.14 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  51.8 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  50.49 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  52.39 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  50.89 
 
 		 395 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  51.89 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  49.76 
 
 		 418 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  52.39 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  47.72 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  49.03 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  49.75 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  48.9 
 
 		 412 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  49.5 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  48.66 
 
 		 412 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  48.8 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  48.05 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  49.14 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  48.66 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  50.83 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  50.49 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  48.41 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  50 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  50.86 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  49.76 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  48.26 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  48.93 
 
 		 419 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  49.52 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  49.87 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  49.38 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  48 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  47.87 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  47.89 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  49.1 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  48.31 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  49.1 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  49.14 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  49.1 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  47.49 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  48.88 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  48.08 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  47.83 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  49.64 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  47.13 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  47.58 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  47.83 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  49.37 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  49.23 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  46.59 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  49.11 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  48.42 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  46.71 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  45.91 
 
 		 421 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  47.84 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  45.56 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  50.73 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  49.87 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  50.73 
 
 		 409 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  43.55 
 
 		 433 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  44.25 
 
 		 420 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  45.52 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  42.82 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  44.34 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  44.1 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  46.06 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  43.55 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  46.96 
 
 		 416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  44.31 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  44.02 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  43.84 
 
 		 417 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  45.23 
 
 		 410 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  42.72 
 
 		 418 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  44.07 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  43.6 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  43.87 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  44.23 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  39.86 
 
 		 420 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  39.71 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  42.12 
 
 		 426 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  42.36 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  44.87 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  40.41 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  43.59 
 
 		 418 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  39.42 
 
 		 447 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  40.14 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  42.01 
 
 		 408 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  39.24 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  41.56 
 
 		 417 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  41.4 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  39.14 
 
 		 439 aa  299  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  42.4 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  39.2 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  39.52 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  38.93 
 
 		 440 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  38.95 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  37.81 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  37.5 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>