219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0953 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  100 
 
 
418 aa  847    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  91.39 
 
 
418 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  58 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  53.83 
 
 
417 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  54.35 
 
 
410 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  53.62 
 
 
410 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  50.35 
 
 
421 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  50.35 
 
 
421 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  51.61 
 
 
427 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  50.25 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  51.09 
 
 
416 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  49.29 
 
 
422 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  48.26 
 
 
421 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  48.62 
 
 
412 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  50.24 
 
 
409 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  49.52 
 
 
409 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  42.72 
 
 
429 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  43.2 
 
 
429 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  43.2 
 
 
429 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  43.17 
 
 
429 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  46.04 
 
 
421 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  46.42 
 
 
411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  45.3 
 
 
422 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  43.58 
 
 
423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  45.59 
 
 
424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  41.49 
 
 
433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  46.65 
 
 
416 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  41.49 
 
 
429 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  42.07 
 
 
433 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  41.26 
 
 
433 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  45.05 
 
 
431 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  43.32 
 
 
423 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  42.68 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  43.83 
 
 
428 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  42.01 
 
 
433 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  44.25 
 
 
430 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  43.6 
 
 
418 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  42.72 
 
 
417 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  43.75 
 
 
430 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  43.51 
 
 
418 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  39.95 
 
 
420 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  42.48 
 
 
439 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  43.1 
 
 
418 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  41.63 
 
 
417 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  45.34 
 
 
416 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  43.28 
 
 
418 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  41.67 
 
 
426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  42.61 
 
 
418 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  43.25 
 
 
430 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  41.39 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  44.05 
 
 
415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.87 
 
 
417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  42.57 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  41.23 
 
 
418 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  42.03 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  42.24 
 
 
412 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  40.93 
 
 
422 aa  305  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  43.39 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  41.77 
 
 
412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  41.71 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  41.3 
 
 
422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  44.3 
 
 
416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  41.29 
 
 
412 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  43.1 
 
 
416 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  40.76 
 
 
419 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  40.95 
 
 
460 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  43.75 
 
 
416 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  41.16 
 
 
441 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  41.9 
 
 
431 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  40 
 
 
424 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  42.37 
 
 
416 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  41.19 
 
 
412 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  41.25 
 
 
427 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  42.13 
 
 
416 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  43.5 
 
 
416 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  40.15 
 
 
430 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  41.47 
 
 
439 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.13 
 
 
416 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.87 
 
 
423 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  41.59 
 
 
439 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  40.59 
 
 
420 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  41.87 
 
 
423 aa  293  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  41.11 
 
 
431 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  43.55 
 
 
421 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  40.35 
 
 
420 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  41.65 
 
 
445 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  41.71 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  41.09 
 
 
417 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  40.85 
 
 
442 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  42.28 
 
 
429 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  40.9 
 
 
410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  40.59 
 
 
427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  41.75 
 
 
417 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  40.94 
 
 
437 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  41.5 
 
 
417 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  38.7 
 
 
424 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  40.46 
 
 
440 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  40.66 
 
 
443 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  38.9 
 
 
413 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  40.43 
 
 
417 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>