223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2839 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_33410  porin  90.79 
 
 		 472 aa  841    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  100 
 
 		 467 aa  951    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  47.25 
 
 		 444 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  45.74 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  45.5 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  44.01 
 
 		 444 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  43.55 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  43.55 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  43.55 
 
 		 444 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  34.43 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  34.43 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  34.43 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  34.43 
 
 		 447 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  36.81 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  36.67 
 
 		 447 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  36.67 
 
 		 447 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  35.86 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  36.51 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  33.54 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  35.35 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  37.73 
 
 		 435 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  34.9 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  37.05 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  34.85 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  31.93 
 
 		 440 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  35.99 
 
 		 420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  36.4 
 
 		 448 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  34.93 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  36.19 
 
 		 445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  36.43 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  35.31 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  34.92 
 
 		 454 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  34.09 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  36.47 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  35.08 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  35.37 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  35.97 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  35.97 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  32.88 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  34.85 
 
 		 455 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  33.03 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  32.08 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  34.85 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  34.01 
 
 		 452 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  34.47 
 
 		 452 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  34.72 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  31.34 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  31.58 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  32.15 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  31.85 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  30.93 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  32.54 
 
 		 421 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  32.39 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  31.31 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  32.39 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  29.53 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  32.39 
 
 		 429 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  29.31 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  30.81 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  30.81 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  29.71 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  29.72 
 
 		 427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  32.78 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  32.49 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  31.96 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  32.15 
 
 		 417 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  30.5 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  28.89 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  30.72 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  29.58 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  33.16 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  29.1 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  29.45 
 
 		 447 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  28.17 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  29.8 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  33.18 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  28.51 
 
 		 422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  31.07 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  27.24 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  31.5 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  28.48 
 
 		 463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  28.51 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  30.52 
 
 		 417 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  30.29 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  28.1 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  30.29 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  29.42 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  29.11 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  32.47 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  30.4 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  30.81 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  30.57 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  30.27 
 
 		 417 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  29.48 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  28.64 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  28.78 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  29.84 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  28.3 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  29.25 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  30.2 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>