218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32270 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  90.18 
 
 		 455 aa  805    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  100 
 
 		 448 aa  905    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  62.08 
 
 		 440 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  61.68 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  60.27 
 
 		 441 aa  558  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  60.09 
 
 		 441 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  63.07 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  63.07 
 
 		 447 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  60.18 
 
 		 446 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  63.53 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  58.07 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  58.07 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  58.07 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  58.07 
 
 		 447 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  59.67 
 
 		 441 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  44.66 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  42.54 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  42.13 
 
 		 443 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  41.35 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  41.55 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  41.27 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  43.09 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  41.55 
 
 		 479 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  40.46 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  40.98 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  41.65 
 
 		 421 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  41.2 
 
 		 421 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  40.35 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  39.86 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  40.44 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  40.89 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  41.11 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  40.13 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  39.08 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  41.11 
 
 		 444 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.44 
 
 		 448 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  40.17 
 
 		 444 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  39.2 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  38.23 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  39.44 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  37.78 
 
 		 425 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  41.75 
 
 		 414 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  39.32 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  37.86 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  39.81 
 
 		 427 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  37.86 
 
 		 420 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  39.33 
 
 		 427 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  37.5 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  38.01 
 
 		 435 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  36.57 
 
 		 435 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  36.21 
 
 		 425 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  37.28 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  36.05 
 
 		 411 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  35.99 
 
 		 425 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  38.86 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  37.05 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  38.19 
 
 		 421 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  36.82 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  36.76 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  37.64 
 
 		 421 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  36.02 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  35.4 
 
 		 467 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  36.51 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  37.76 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  35.76 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  36.97 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  36.19 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  36.54 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  36.49 
 
 		 418 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  35.9 
 
 		 417 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  37.96 
 
 		 431 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  36.9 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  36.49 
 
 		 429 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  39.52 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  36.1 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  36.98 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  36.94 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  36.45 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  35.41 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  39.67 
 
 		 416 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  35.33 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  36.89 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  34.54 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  36.89 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  36.01 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  35.12 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  34.54 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  36.21 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  35.67 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  38.11 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  34.44 
 
 		 424 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  34.68 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  36.65 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.35 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  34.35 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  34.22 
 
 		 413 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  35.28 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  34.54 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  33.78 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  37.38 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>