222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_18150 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  100 
 
 
411 aa  842    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  56.97 
 
 
421 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  56.97 
 
 
421 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  55.69 
 
 
412 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  54.09 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  52.59 
 
 
422 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  52.74 
 
 
427 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  51.98 
 
 
427 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  51.43 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  47.32 
 
 
429 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  48.56 
 
 
421 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  47.84 
 
 
416 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  46.4 
 
 
429 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  47.15 
 
 
429 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  46.65 
 
 
429 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  49.64 
 
 
409 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  49.64 
 
 
409 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  45.82 
 
 
416 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  45.41 
 
 
415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  46.48 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  44.74 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  46.52 
 
 
417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  45.31 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  44.5 
 
 
431 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  46.27 
 
 
410 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  46.23 
 
 
410 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  45.99 
 
 
410 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  45.28 
 
 
416 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  45.73 
 
 
418 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  43 
 
 
433 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  42.21 
 
 
433 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  45.52 
 
 
416 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  41.79 
 
 
429 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  41.79 
 
 
433 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  40.05 
 
 
437 aa  315  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  42.49 
 
 
439 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  40.71 
 
 
423 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  42.38 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  41.95 
 
 
418 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  41.11 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  41.45 
 
 
440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  42.43 
 
 
430 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  40.82 
 
 
405 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  41.08 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  43.07 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  39.69 
 
 
460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  40.85 
 
 
420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  40.49 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  40.75 
 
 
420 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  41.22 
 
 
443 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  39.3 
 
 
463 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  40.83 
 
 
417 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  40.65 
 
 
418 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  40.55 
 
 
418 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  40.33 
 
 
427 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  40.98 
 
 
417 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  40.33 
 
 
439 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  40.44 
 
 
456 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  39.81 
 
 
422 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  41.5 
 
 
416 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  41.4 
 
 
442 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  39.61 
 
 
416 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  42.82 
 
 
408 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  39.47 
 
 
417 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  40.19 
 
 
426 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  38.74 
 
 
420 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  39.33 
 
 
422 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  39.18 
 
 
412 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  40.53 
 
 
428 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  38.7 
 
 
412 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  38.94 
 
 
412 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  40.82 
 
 
416 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  39.29 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  38.46 
 
 
412 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  39.27 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  40.25 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  39.3 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  40.25 
 
 
416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  40.23 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  39.24 
 
 
395 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  39.86 
 
 
422 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  37.71 
 
 
417 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  37.86 
 
 
418 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  39.02 
 
 
417 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  37.62 
 
 
418 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  38.59 
 
 
423 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  38.56 
 
 
430 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  37.38 
 
 
418 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  38.92 
 
 
431 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  38.42 
 
 
417 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  37.92 
 
 
415 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  39.52 
 
 
424 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  38.66 
 
 
421 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  37.65 
 
 
416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  38.29 
 
 
428 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  37.81 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  37.72 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  38.75 
 
 
427 aa  272  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  37.56 
 
 
430 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  37.11 
 
 
447 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>