214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29220 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_29220  putative porin  100 
 
 		 435 aa  870    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  97.24 
 
 		 435 aa  845    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  62.56 
 
 		 420 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  62.09 
 
 		 420 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  61.37 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  58.53 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  41.83 
 
 		 446 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  42.35 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  42.04 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  43.17 
 
 		 445 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  41.77 
 
 		 445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  38.06 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.07 
 
 		 448 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  39.53 
 
 		 448 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  41.06 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  37.75 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  37.47 
 
 		 479 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  37.25 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  41.47 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  35.1 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  35.1 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  35.1 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  35.1 
 
 		 447 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  38.76 
 
 		 468 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  36.47 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  36.47 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  35.49 
 
 		 422 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  36.42 
 
 		 427 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  37.96 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  35.71 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  37.36 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  36.79 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  35.99 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  38.5 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  38.74 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  37.02 
 
 		 444 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  34.62 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  37.23 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  37.02 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  33.92 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  36.18 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  34.17 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  36.4 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  37.77 
 
 		 448 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  37.42 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  37.73 
 
 		 467 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  33.41 
 
 		 429 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  36.96 
 
 		 444 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  36.03 
 
 		 411 aa  230  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  35.7 
 
 		 421 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  35.66 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  35.41 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  34.43 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  35.48 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  37.14 
 
 		 414 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.41 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  37.76 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  36.5 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  34.32 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.16 
 
 		 429 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  33.91 
 
 		 429 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  35.83 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  35.31 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  33.86 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  38.15 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  31.91 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  35.28 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  37.5 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  31.42 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  37.25 
 
 		 417 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.72 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  34.2 
 
 		 417 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  36.01 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  34.75 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  35 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  34.75 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  33.79 
 
 		 431 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  33.79 
 
 		 431 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  32.79 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  34.5 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  31.51 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  33.94 
 
 		 417 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  36.5 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  34.23 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  36.25 
 
 		 409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  33.25 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  31.05 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.51 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  33.58 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  34.98 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  33.07 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  31.89 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  33.67 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  32.11 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  33.5 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  33.5 
 
 		 430 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.41 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  32.76 
 
 		 431 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  33.33 
 
 		 413 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  32.07 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>