214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  87.61 
 
 		 452 aa  781    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  100 
 
 		 452 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  42.25 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  41.12 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  39.96 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  39.06 
 
 		 448 aa  299  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  40.69 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  38.43 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  39.86 
 
 		 445 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  43.13 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  37.96 
 
 		 447 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  41.94 
 
 		 435 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  36.26 
 
 		 449 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  37.58 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  37.58 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  37.58 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  37.58 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  36.09 
 
 		 479 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  36.93 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  38.95 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  35.31 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  39.19 
 
 		 447 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  38.74 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  36.68 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  38.44 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  38.32 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  36.09 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  36.51 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  36.07 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  35.56 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  36.96 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  36.96 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  34.97 
 
 		 441 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  35.48 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  36.47 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  38.23 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  34.35 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  34.35 
 
 		 421 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  34.35 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  37.2 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  38.07 
 
 		 438 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  38.22 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  36.4 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  36.04 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  36.76 
 
 		 444 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  36.76 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  35.73 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  36.36 
 
 		 452 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  33.48 
 
 		 454 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  33.41 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  31 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  35.93 
 
 		 416 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.26 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.26 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.26 
 
 		 429 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  35.7 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  32.88 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  32.95 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  34.87 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  33.11 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  32.64 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  32.79 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  32.06 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  32.56 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  32.56 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  32.33 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  32.88 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  32.79 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  35.33 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  31.54 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  30.94 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  34.41 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  33.02 
 
 		 417 aa  190  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  33.04 
 
 		 431 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  33.33 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  30.7 
 
 		 430 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  34.35 
 
 		 409 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  34.11 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  29.76 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  30.94 
 
 		 433 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  29.54 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  30.93 
 
 		 430 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  30.93 
 
 		 416 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  32.2 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  31.39 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  30.47 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  32.41 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  30.56 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  33.26 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  32.2 
 
 		 484 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  31.53 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.41 
 
 		 421 aa  183  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  31.11 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  31.64 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  31.76 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  31.15 
 
 		 417 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  31.31 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  30.68 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  30.93 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  31.93 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>