216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2708 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  100 
 
 		 431 aa  879    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  65.59 
 
 		 420 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  64.3 
 
 		 420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  63.54 
 
 		 420 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  58.53 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  60.86 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  44.5 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  41.29 
 
 		 446 aa  348  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  44.5 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  42.43 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  41.97 
 
 		 443 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  40.77 
 
 		 448 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  39.76 
 
 		 447 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  42.14 
 
 		 421 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  41.9 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  37.9 
 
 		 448 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  39.52 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  38.5 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  38.14 
 
 		 427 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  39.76 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  38.04 
 
 		 441 aa  279  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  38.48 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  38.73 
 
 		 440 aa  275  8e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  39.62 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  39.81 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  38.37 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  38.04 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  36.63 
 
 		 446 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  37.41 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  37.92 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  39.34 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  39.34 
 
 		 447 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  35.81 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  37.68 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  37.59 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  37.59 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  37.59 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  37.3 
 
 		 452 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  37.59 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  35.4 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  34.63 
 
 		 479 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  34.65 
 
 		 433 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  35.1 
 
 		 429 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  35.2 
 
 		 429 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  37.15 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  34.63 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  36.22 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  34.94 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.62 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  37.26 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.38 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  37.03 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  33.33 
 
 		 429 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  36.59 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  37.39 
 
 		 417 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  33.26 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  35.55 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  37.76 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  34.33 
 
 		 431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  36.93 
 
 		 454 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  35.78 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  34.1 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  35.78 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  35.4 
 
 		 444 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  37.61 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  33.26 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  33.8 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  36.16 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  34.78 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  35.93 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  33.81 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  34.03 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  34.25 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  33.48 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.97 
 
 		 421 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.97 
 
 		 421 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  34.58 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  35.45 
 
 		 409 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  32.41 
 
 		 426 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.64 
 
 		 421 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  35.57 
 
 		 452 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  34.02 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  35.17 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  35.24 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  32.88 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  33.57 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  34.11 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  34.74 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  33.85 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  34.98 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  35.2 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  33.95 
 
 		 416 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  35.57 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  35.57 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  35.33 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  35.5 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  33.18 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  34.72 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  32.18 
 
 		 427 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  34.95 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>