221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  100 
 
 		 428 aa  866    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  56.53 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  56.89 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  55.61 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  55.89 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  55.64 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  54.31 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  54.07 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  54.07 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  53.01 
 
 		 416 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  46.59 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  46.59 
 
 		 416 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  45.24 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  45 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  43.51 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  42.55 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  40.76 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  40.38 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  40.76 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  40.76 
 
 		 418 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  42.46 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  41.12 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  40.43 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  43.3 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  39.8 
 
 		 395 aa  312  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  42.72 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  41.45 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  42.52 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  41.16 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  40.93 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  38.72 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  40.24 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  41.9 
 
 		 433 aa  302  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  40.37 
 
 		 424 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  38.17 
 
 		 412 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  41.61 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  42.04 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  39.46 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  41.79 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  39.19 
 
 		 410 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  40.71 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  37.94 
 
 		 412 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  38.32 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  38.52 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  38.37 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  40.52 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  39.46 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  42.11 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  38.79 
 
 		 422 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  38.1 
 
 		 419 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  39.62 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  38.39 
 
 		 412 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  40.43 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  40.88 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  41.35 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.24 
 
 		 412 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  41.12 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  40.88 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  38.12 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  41.13 
 
 		 421 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  40.2 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  40.49 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  40.43 
 
 		 411 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  42.46 
 
 		 416 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  39.7 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  41.81 
 
 		 416 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  41.79 
 
 		 418 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.6 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  35.73 
 
 		 413 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  40.38 
 
 		 417 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.15 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  41.13 
 
 		 416 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  40.14 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  39.68 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  36.3 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  39.19 
 
 		 417 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  39.47 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  39.19 
 
 		 410 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  39.66 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  40.4 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  35.83 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  38.72 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  39.55 
 
 		 418 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  38.02 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17320  outer membrane porin  38.67 
 
 		 402 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  38.86 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  37.47 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  36.62 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  36.18 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  37.41 
 
 		 408 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  36.03 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  38.56 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  36.02 
 
 		 463 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  39.1 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  38.86 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  38.69 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  36.82 
 
 		 440 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  34.93 
 
 		 440 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  36.19 
 
 		 457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  34.66 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>