219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10440 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  91.39 
 
 		 418 aa  758    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  100 
 
 		 418 aa  853    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  56 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  54.5 
 
 		 410 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  54.25 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  54.5 
 
 		 410 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  50.35 
 
 		 421 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  51.73 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  50.35 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  50.62 
 
 		 427 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  51.34 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  49.64 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  49.52 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  49.5 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  49.76 
 
 		 409 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  44.87 
 
 		 429 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  43.88 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  44.87 
 
 		 429 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  44.63 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  49.15 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  46.15 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  46.4 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  46.35 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  44.31 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  45.68 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  43.72 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  42 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  43.95 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  45.09 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  43.3 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  42.23 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  43.8 
 
 		 418 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  43.55 
 
 		 418 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  41.72 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  44.53 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  42.43 
 
 		 405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  41.49 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  43.03 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  44.84 
 
 		 416 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  41.72 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  44.44 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  43.07 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  40.14 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  42.24 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  41.41 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  44.29 
 
 		 415 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  43.25 
 
 		 430 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  42.75 
 
 		 430 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  43.13 
 
 		 416 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  42.03 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  41.94 
 
 		 418 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  40.93 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  41 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  41.98 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  42.75 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  45 
 
 		 416 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  42.21 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  41.23 
 
 		 417 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  41.22 
 
 		 463 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  42.41 
 
 		 416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  40.82 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  40.76 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  44.75 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  42.17 
 
 		 416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  42.64 
 
 		 415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  43.22 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  42.23 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.17 
 
 		 416 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  42.89 
 
 		 412 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  42.62 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  42.43 
 
 		 412 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  42.39 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  42.53 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  42.82 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  43.13 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  40.49 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  42.38 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  42.39 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  40.82 
 
 		 460 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  41.43 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  40.84 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  39.57 
 
 		 419 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  40.57 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  41.88 
 
 		 445 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  40.35 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  42.4 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  41.84 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.63 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  40.82 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  41.55 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  41.63 
 
 		 423 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  40.82 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  40.48 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  39.95 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  40.66 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  40.65 
 
 		 410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  39.4 
 
 		 413 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  40.95 
 
 		 417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  39.86 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  41.13 
 
 		 443 aa  286  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>