221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2839  porin  90.79 
 
 		 467 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  100 
 
 		 472 aa  954    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  47.71 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  47.25 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  44.79 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  44.93 
 
 		 444 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  44.47 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  44.01 
 
 		 444 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  44.01 
 
 		 444 aa  339  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  37.47 
 
 		 447 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  38.02 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  38.02 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  36.24 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  36.24 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  36.24 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  36.24 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  33.68 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  36.53 
 
 		 441 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  36.28 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  35.41 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  33.97 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  37.76 
 
 		 435 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  33.79 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  37.01 
 
 		 445 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  36.54 
 
 		 420 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  35.31 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  37.77 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  37.44 
 
 		 435 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  36.47 
 
 		 448 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  35.39 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  34.85 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  36.06 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  34.32 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  35.06 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  33.26 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  36.21 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  34.99 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  33.26 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  33.03 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  34.24 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  33.79 
 
 		 447 aa  223  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  34.62 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  35.33 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  36.04 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  35.19 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  33.79 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  31.1 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  31.1 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  31.6 
 
 		 413 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  32.86 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  32.15 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  31.06 
 
 		 422 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  31.35 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  29.95 
 
 		 427 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  30.33 
 
 		 459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  31.35 
 
 		 421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  30.51 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  33.18 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  29.71 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  31.68 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  30.29 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  31.82 
 
 		 421 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  29.51 
 
 		 459 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  31.44 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  30.52 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  32.72 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  30.07 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  31.7 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  31.84 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  30.02 
 
 		 428 aa  180  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  32.94 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  28.54 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  30.68 
 
 		 424 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  30.88 
 
 		 418 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  28.63 
 
 		 463 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  32.18 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  30.58 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  30.09 
 
 		 440 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  29.62 
 
 		 422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  32.24 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  29.3 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  33.16 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  31.28 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  29.11 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  31.19 
 
 		 417 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  29.57 
 
 		 412 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  32.72 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  31.47 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  30.46 
 
 		 416 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  30.46 
 
 		 416 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  30.27 
 
 		 417 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  26.72 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  29.25 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  29.48 
 
 		 411 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  30.2 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  31.25 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  30.24 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  31.4 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  31.07 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  32.03 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>