218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0295 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  100 
 
 		 428 aa  862    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  71.96 
 
 		 425 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  71.73 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  69.46 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  69.23 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  69 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  69.46 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  71.86 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  71.4 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  60.75 
 
 		 418 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  52.42 
 
 		 417 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  47.55 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  48.2 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  47.62 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  47.48 
 
 		 421 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  47.48 
 
 		 421 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  46.33 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  39.78 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  40.04 
 
 		 443 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  41.43 
 
 		 414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  39 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  39.31 
 
 		 448 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  34.64 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  38.9 
 
 		 447 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  36.73 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  35.67 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  35.85 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  35.85 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  35.85 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  35.85 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  35.22 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  37.04 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  35.53 
 
 		 440 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  36.98 
 
 		 455 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  34.35 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  35.85 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  33.86 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  38.67 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  35.75 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  35.81 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  33.33 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  36.08 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  36.04 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  35.81 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  37.56 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  35.35 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  35.63 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  32.96 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  35.35 
 
 		 418 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  34.93 
 
 		 449 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  34.01 
 
 		 416 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  34.37 
 
 		 444 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  34.81 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  35.42 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  32.74 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.86 
 
 		 427 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  34.59 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  31.53 
 
 		 416 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  35.65 
 
 		 424 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  33.77 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  33.18 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  34.93 
 
 		 395 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  34.5 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  34.27 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  33.18 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  34.77 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  34.92 
 
 		 420 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  33.92 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  32.71 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  35.63 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  33.73 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  34.86 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  34.86 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  33.86 
 
 		 410 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  32.54 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  31.75 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  31.69 
 
 		 433 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  32.65 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  34.22 
 
 		 413 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  33.89 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  32.55 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  32.55 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  33.33 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  33.07 
 
 		 410 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  34.57 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  33.17 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  31.92 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  31.92 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  32.81 
 
 		 410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  33.11 
 
 		 420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  32.89 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  36.08 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  31.37 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  32.65 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  32.94 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  31.39 
 
 		 422 aa  196  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  34.88 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  33.71 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  31.99 
 
 		 444 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>