242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3160 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  92.42 
 
 		 417 aa  770    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  100 
 
 		 418 aa  843    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  88.52 
 
 		 417 aa  735    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  74.88 
 
 		 417 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  92.42 
 
 		 417 aa  769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  47.55 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  45.85 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  45.6 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  45.93 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  47.06 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  47.3 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  45.24 
 
 		 421 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  45.24 
 
 		 421 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  44.84 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  46.28 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  42.12 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  42.15 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.99 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  43.67 
 
 		 447 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  47.09 
 
 		 416 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  43.83 
 
 		 412 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  43.87 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  44.08 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  40.94 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  40.78 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  43.91 
 
 		 416 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  40.32 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  41.87 
 
 		 439 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  43.82 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  43.89 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  41.96 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  41.71 
 
 		 433 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  44.42 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  40.8 
 
 		 440 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  42.11 
 
 		 433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  45.63 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  41.07 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  42.62 
 
 		 423 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  42.52 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  42.76 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  42.72 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  42.04 
 
 		 408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  43.48 
 
 		 416 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  43.48 
 
 		 416 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  41.95 
 
 		 411 aa  309  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  43.24 
 
 		 416 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  40.89 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  41.4 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  41.3 
 
 		 408 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  40 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.75 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  40.31 
 
 		 456 aa  302  6.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  42 
 
 		 417 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  40.89 
 
 		 427 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  43.63 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  40.81 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2927  outer membrane porin OprE  39.37 
 
 		 443 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  42 
 
 		 418 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  43.16 
 
 		 409 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  38.59 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  41.25 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  40.94 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  39.61 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  39.81 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  41.32 
 
 		 423 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  41.08 
 
 		 423 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  39.61 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  39.24 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22560  OprE-like outer membrane porin  40.27 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  40.94 
 
 		 440 aa  295  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  40.42 
 
 		 440 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  40.33 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  41.67 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  40.86 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  40.15 
 
 		 417 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  41.3 
 
 		 417 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  37.56 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  37.79 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  39.42 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  39.29 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  41.53 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  40.59 
 
 		 418 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  41.05 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  39.81 
 
 		 415 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  40.48 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  38.57 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  39.5 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  40.19 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  40.19 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19070  outer membrane porin, OprE-like protein  39.1 
 
 		 442 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  38.27 
 
 		 442 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  40.13 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  37.77 
 
 		 416 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  38.9 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.2 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  38.34 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  38.11 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  38.34 
 
 		 430 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  38.99 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  37.71 
 
 		 412 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>