227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0242  porin  96.85 
 
 		 444 aa  848    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  100 
 
 		 444 aa  907    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  62.47 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  60.94 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  61.38 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  60.71 
 
 		 444 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  61.38 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  47.25 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  47.71 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  42.95 
 
 		 441 aa  339  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  41.68 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  41.68 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  41.68 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  41.68 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  42.21 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  42.63 
 
 		 447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  40.83 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  42.98 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  40.65 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  41.5 
 
 		 447 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  41.5 
 
 		 447 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  41.06 
 
 		 449 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  41.06 
 
 		 479 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  41.43 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  41.46 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  41.72 
 
 		 446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  43.21 
 
 		 448 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  39.05 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  40.93 
 
 		 448 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  39.56 
 
 		 441 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  41.37 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  39.29 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  38.48 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  41.1 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  37.42 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  37.25 
 
 		 427 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  37.94 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  39.08 
 
 		 420 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  37.94 
 
 		 421 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  37.53 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  37.62 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  39.61 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  39.22 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  39.61 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  37.03 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  37.5 
 
 		 435 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  37.42 
 
 		 435 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  39.41 
 
 		 452 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  35.02 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  38.58 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  36.41 
 
 		 427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  36.17 
 
 		 427 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  35.15 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.1 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  33.64 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  35.68 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  35.46 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  34.82 
 
 		 422 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  35.12 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  34.44 
 
 		 421 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  34.01 
 
 		 424 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  37.82 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.22 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  34.16 
 
 		 411 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  35.45 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  35.45 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  33.64 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  33.63 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  35.64 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  34.69 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  35.37 
 
 		 429 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  34.88 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  32.96 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  34.88 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  34.65 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  34.98 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  35.63 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  35.22 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  36.99 
 
 		 416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  35.15 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  34.99 
 
 		 415 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.99 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  35.01 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  34.38 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  35.05 
 
 		 416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.99 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  34.86 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  36.28 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  33.93 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  33.73 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  33.96 
 
 		 416 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  33.93 
 
 		 426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  33.96 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  34.53 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  34.2 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  31.44 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  33.71 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  31.93 
 
 		 428 aa  213  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  34.02 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  32.74 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>