217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_51880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  93 
 
 		 441 aa  840    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  100 
 
 		 443 aa  904    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  66.59 
 
 		 447 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  63.8 
 
 		 448 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  65.04 
 
 		 448 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  51.84 
 
 		 446 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  48.25 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  50.66 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  50.11 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  50.88 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  50.88 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  44.88 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  44.21 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  45.68 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  41.97 
 
 		 431 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  42.04 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  42.7 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  42.7 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  42.7 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  42.7 
 
 		 447 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  42.86 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  42.64 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  43.08 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  42.89 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  42.89 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  42.34 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  41.46 
 
 		 435 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  42.79 
 
 		 446 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  44.58 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  41.99 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  42.46 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  41.72 
 
 		 452 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  42.57 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  43 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  42.89 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  41.76 
 
 		 447 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  41.76 
 
 		 447 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  42.89 
 
 		 420 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  42.07 
 
 		 455 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  40.98 
 
 		 452 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  40 
 
 		 441 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  39.52 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  39.3 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  41.91 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  41.69 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  39.33 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  40.26 
 
 		 428 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  39.39 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  42.82 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  42.13 
 
 		 424 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  41.43 
 
 		 444 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  39.44 
 
 		 468 aa  289  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  41.5 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  37.93 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  39.91 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  39.91 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  37.42 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  39.05 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  37.69 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  39.81 
 
 		 438 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  38.57 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  38.7 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  38.15 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  37.96 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  38.15 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  40.97 
 
 		 444 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  39.47 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  37.25 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  39.25 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  39.04 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  35.86 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  39.12 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  37.2 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  39.47 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  37.12 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  39.13 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  38.89 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  38.59 
 
 		 416 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  38.89 
 
 		 418 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  36.62 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  37.64 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  35.57 
 
 		 433 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  37.04 
 
 		 419 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  36.51 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  38.59 
 
 		 410 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  38.63 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  36.81 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  37.64 
 
 		 412 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  36.96 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  39.05 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  38.11 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  37.62 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  36.06 
 
 		 424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  37.62 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  36.94 
 
 		 430 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  35.97 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  38.91 
 
 		 478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  38.22 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  37.62 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  37.56 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>