215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_34040 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 431 aa  878    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  48.82 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  47.32 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  45.14 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  44.91 
 
 		 425 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  44.47 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  45.71 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  44.03 
 
 		 439 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  44.03 
 
 		 439 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  44.27 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  43.48 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  43.02 
 
 		 424 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  40.47 
 
 		 421 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  40.23 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  39.35 
 
 		 422 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  38.81 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  39.86 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  38.43 
 
 		 441 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  40.68 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  37.36 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  36.18 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  35.82 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  37 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  38.65 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  37.16 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  37.84 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  34.06 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  34.87 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  33.04 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  32.61 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  34.87 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  32.61 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.84 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  32.37 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  35.35 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  35.45 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  33.94 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  32.07 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  34.62 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  35.45 
 
 		 447 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  33.64 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  31.45 
 
 		 441 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  33.89 
 
 		 429 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  34.62 
 
 		 424 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.51 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  35.23 
 
 		 447 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  33.65 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  33.03 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  33.65 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  31.86 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  33.03 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  35.12 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  33.03 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  31.75 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  33.03 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  34.61 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  34.68 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  34.66 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  34.31 
 
 		 428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  35.97 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  33.11 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  35.31 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  34.08 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  34.19 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  34.96 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  34.58 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  33.86 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  34.08 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  31.58 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  32.24 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  34.04 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  32.95 
 
 		 411 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  33.48 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  33.65 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  33.49 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  32.26 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  31.94 
 
 		 440 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  33.88 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  32.94 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  34.32 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  33.64 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  31.94 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  34 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  32.02 
 
 		 446 aa  194  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  33.78 
 
 		 416 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  34 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  31.7 
 
 		 429 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  32.35 
 
 		 418 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  31.76 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  31.47 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  32.88 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  33.03 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  32.27 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  32.48 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  35.32 
 
 		 420 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  32.69 
 
 		 426 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  33.18 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  30.54 
 
 		 433 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  33.11 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  32.47 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>