228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0284 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  100 
 
 		 439 aa  895    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  94.99 
 
 		 439 aa  829    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  98.18 
 
 		 439 aa  880    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  100 
 
 		 439 aa  895    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  69.46 
 
 		 428 aa  588  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  65.68 
 
 		 425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  65.91 
 
 		 425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  64.01 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  62.87 
 
 		 424 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  55.35 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  50.79 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  45.49 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  44.39 
 
 		 431 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  46.53 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  46.55 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  42.33 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  43.81 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  43.3 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  41.16 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  39.15 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  38.77 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  39.86 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  36.6 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  38.3 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  35.31 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  35.31 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  35.31 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  35.31 
 
 		 447 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  35.16 
 
 		 441 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  34.98 
 
 		 441 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  34.88 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  35.13 
 
 		 441 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  37 
 
 		 445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  35.64 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  36.98 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  36.74 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  33.92 
 
 		 416 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  35.7 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  34.78 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  36.34 
 
 		 445 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  35.48 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  34.54 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  35.47 
 
 		 433 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  36.07 
 
 		 431 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  35.01 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  35.01 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  34.65 
 
 		 427 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  35.68 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  35.71 
 
 		 447 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  35.71 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  34.19 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.81 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.81 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.81 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  32.74 
 
 		 421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  35.02 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  35.45 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  35.38 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  34.58 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  35.16 
 
 		 463 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  34.8 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  35.02 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  36 
 
 		 418 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  36.53 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  35.38 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  34.16 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  33.04 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  36.06 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0234  outer membrane porin  34.47 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151017  decreased coverage  0.000172994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  35.56 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  32.33 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  35.28 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  34.11 
 
 		 460 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  33.71 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  34.32 
 
 		 433 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  34.35 
 
 		 395 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  32.64 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  32.31 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0258  outer membrane porin  35.29 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  34.07 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  32.96 
 
 		 421 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  34.81 
 
 		 424 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  33.33 
 
 		 442 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  35.14 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  35.1 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  35.78 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  33.03 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  33.86 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  33.11 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  32.16 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  34.99 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  33.77 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  34.75 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  32.31 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  32.19 
 
 		 438 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  34.51 
 
 		 420 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  34.19 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0249  outer membrane porin  34.11 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00208088  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  34.52 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  32.31 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>