224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2476 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  100 
 
 		 425 aa  868    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  99.76 
 
 		 425 aa  867    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  72.2 
 
 		 428 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  66.82 
 
 		 439 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  66.14 
 
 		 439 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  65.68 
 
 		 439 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  65.68 
 
 		 439 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  69.32 
 
 		 424 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  68.85 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  62.35 
 
 		 418 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  56.28 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  49.09 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  49.3 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34040  OprD family outer membrane porin  45.83 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  49.07 
 
 		 421 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  47.71 
 
 		 427 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  47.1 
 
 		 422 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  42.51 
 
 		 443 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  41.41 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  37.85 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  41.23 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  40.63 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  40.52 
 
 		 448 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  40.73 
 
 		 447 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  35.21 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  34.7 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  35 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  34.7 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  34.7 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  34.7 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  35.81 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  35.54 
 
 		 440 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  34.71 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  34.72 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  33.26 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  36.28 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  36.64 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  34.91 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  36.51 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  36.51 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  36.28 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  37.44 
 
 		 419 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  36.19 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  35.27 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  35.9 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  33.48 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  33.26 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  35.08 
 
 		 421 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  36.14 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  35.78 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  35.04 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  36.16 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  36.1 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  35.37 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  35.92 
 
 		 447 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  37.05 
 
 		 418 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  35.01 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  34.27 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  34 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  34.5 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  36.99 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  35.68 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  35.46 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  32.96 
 
 		 423 aa  212  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  33.5 
 
 		 410 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  33.94 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  35.46 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  37.47 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  38.05 
 
 		 412 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  33.56 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.8 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  33.33 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  33.71 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  34.4 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  33.85 
 
 		 449 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  34.37 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  35.85 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  34.38 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  34.17 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  34.17 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  34.38 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  33.94 
 
 		 421 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  33.03 
 
 		 422 aa  206  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  34.4 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  31.91 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  35.11 
 
 		 413 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  33.81 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  34.94 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  33.72 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  32.19 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  32.06 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  34.13 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  35.99 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  33.56 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  33.1 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  32.38 
 
 		 433 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  33.57 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  32.95 
 
 		 421 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  33.41 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  32.68 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>