223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2734 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  100 
 
 		 455 aa  917    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  90.18 
 
 		 448 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  64.17 
 
 		 440 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  62.27 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  60.85 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  61.14 
 
 		 441 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  61.21 
 
 		 446 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  63.53 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  63.76 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  63.38 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  57.88 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  57.88 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  57.88 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  57.88 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  60.05 
 
 		 441 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  44.88 
 
 		 446 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  43.53 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  42.07 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  41.86 
 
 		 448 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  43.62 
 
 		 449 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  42.82 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  41.92 
 
 		 454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  43.39 
 
 		 479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  41.96 
 
 		 421 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  41.29 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  40.53 
 
 		 444 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  40.18 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  40.75 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  40.35 
 
 		 427 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  38.71 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  39.11 
 
 		 448 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  40.9 
 
 		 444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  40.45 
 
 		 444 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  38.34 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  40.9 
 
 		 444 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  39.87 
 
 		 444 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  37.41 
 
 		 445 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  38.94 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  41.18 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  37.86 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  38.73 
 
 		 444 aa  269  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  39.42 
 
 		 420 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  39.71 
 
 		 420 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  40.91 
 
 		 427 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40000  OprD family outer membrane porin  39.68 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0644019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  40.76 
 
 		 414 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  39.71 
 
 		 427 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  38.02 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  36.01 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  35.79 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  38.41 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  38.75 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  36.63 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  36.51 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  35.96 
 
 		 435 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  37.05 
 
 		 421 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  37.05 
 
 		 421 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  35.93 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  37.83 
 
 		 429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  36.16 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  36.76 
 
 		 428 aa  236  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  36.18 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  37.97 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  38.12 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  36.47 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  35.93 
 
 		 417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  37.74 
 
 		 429 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  38.3 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  36.98 
 
 		 416 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  36.94 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0294  outer membrane porin  35.21 
 
 		 439 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  36.04 
 
 		 452 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0268  outer membrane porin  35.7 
 
 		 439 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0284  outer membrane porin  35.7 
 
 		 439 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  36.03 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  35.86 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.01 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  38.07 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  35.63 
 
 		 418 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  35.9 
 
 		 418 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  33.94 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  34.76 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  36.95 
 
 		 426 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.1 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  35.34 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  35.63 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  36.56 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  37.05 
 
 		 416 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  34.39 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  34.31 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4930  outer membrane porin  33.85 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  34.91 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  33.33 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5391  outer membrane porin, OprD family  33.85 
 
 		 424 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  35.1 
 
 		 417 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  34.68 
 
 		 429 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  35.41 
 
 		 431 aa  220  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  35.94 
 
 		 416 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  36.05 
 
 		 433 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  36.01 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>