220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1554 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  100 
 
 
416 aa  829    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  89.66 
 
 
416 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  56.09 
 
 
427 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  55.33 
 
 
427 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  48.87 
 
 
429 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  49.75 
 
 
421 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  48.12 
 
 
429 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  47.87 
 
 
429 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  47.09 
 
 
429 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1363  outer membrane porin  46.36 
 
 
408 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475695  normal  0.0504292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  47.62 
 
 
421 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  47.62 
 
 
421 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  50.99 
 
 
416 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  45.76 
 
 
433 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  45.58 
 
 
433 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  45.04 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  44.55 
 
 
433 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  47.06 
 
 
422 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  44.55 
 
 
429 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  45.82 
 
 
411 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1456  outer membrane porin  45.54 
 
 
408 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  48.62 
 
 
412 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  47.97 
 
 
409 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  47.93 
 
 
416 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  47.02 
 
 
409 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  44.81 
 
 
421 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  44.66 
 
 
410 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  45.39 
 
 
431 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  45.39 
 
 
431 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  46.96 
 
 
416 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  45.63 
 
 
418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  44.42 
 
 
417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  44.42 
 
 
410 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  44.18 
 
 
410 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  45.87 
 
 
417 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  45.63 
 
 
417 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  43.93 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  44.3 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  40.96 
 
 
463 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  38.26 
 
 
430 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  42.45 
 
 
418 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  40.57 
 
 
460 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.72 
 
 
416 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1272  outer membrane porin OprE  43.24 
 
 
417 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  41.45 
 
 
439 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  41.26 
 
 
417 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5417  outer membrane porin  38.93 
 
 
447 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0532754  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  41.19 
 
 
415 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  40.68 
 
 
415 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  42.11 
 
 
416 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  40.78 
 
 
417 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  41.4 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  40.49 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  42.79 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  40.62 
 
 
423 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  41.87 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  41.63 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  39.54 
 
 
439 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  38.53 
 
 
440 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49580  OprE-like outer membrane porin  39.2 
 
 
441 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.607029  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.53 
 
 
420 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  42.03 
 
 
417 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.53 
 
 
420 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  39.06 
 
 
439 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  39.39 
 
 
418 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2563  outer membrane porin  37.53 
 
 
427 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0910723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  38.81 
 
 
443 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  38.65 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  42.27 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3390  porin, putative  38.26 
 
 
426 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.808043  normal  0.355784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  38.39 
 
 
417 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  38.3 
 
 
423 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1168  outer membrane porin  39.67 
 
 
442 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.012931  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  39.48 
 
 
457 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  38.65 
 
 
418 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  37.53 
 
 
413 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  38.16 
 
 
418 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  40 
 
 
418 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  37.62 
 
 
412 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  41.13 
 
 
428 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  37.62 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  40.24 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  37.29 
 
 
412 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  36.02 
 
 
440 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  38.86 
 
 
422 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  38.81 
 
 
405 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  36.96 
 
 
437 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  37.2 
 
 
427 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  36.19 
 
 
412 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  39.2 
 
 
426 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  37.91 
 
 
423 aa  259  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  39.04 
 
 
424 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  38.55 
 
 
422 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  37.66 
 
 
423 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  36.63 
 
 
422 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  39.7 
 
 
428 aa  257  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  36.97 
 
 
422 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10640  OprE-like outer membrane porin  37.64 
 
 
456 aa  255  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0112866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  35.58 
 
 
424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  36.34 
 
 
395 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>