215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0752 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4433  outer membrane porin  91.43 
 
 		 529 aa  946    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4500  outer membrane porin  71.69 
 
 		 505 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697186  normal  0.197989 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0356  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 480 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1248  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 486 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0120  outer membrane porin  69.57 
 
 		 474 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00350083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2214  OprD family outer membrane porin  68.98 
 
 		 501 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0752  outer membrane porin for cationic amino acids and peptides  100 
 
 		 499 aa  1029    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5408  outer membrane porin  69.11 
 
 		 490 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1539  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 486 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1729  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 486 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3014  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 527 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0532717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2898  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 527 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0390  OprD family outer membrane porin  69.11 
 
 		 527 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5323  outer membrane porin  69.11 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4861  outer membrane porin  68.88 
 
 		 478 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.054091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4735  outer membrane porin  69.11 
 
 		 478 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5537  outer membrane porin  69.11 
 
 		 478 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00176042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  68.28 
 
 		 479 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  34.87 
 
 		 471 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  35.24 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  35.35 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  35.52 
 
 		 484 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  33.41 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  34.29 
 
 		 459 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  34.07 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  33.41 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  32.12 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  30.85 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  33.86 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  32.51 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  33.11 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  31.96 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  31.28 
 
 		 448 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  33.03 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  30.61 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  29.02 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  30.43 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  31.85 
 
 		 420 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  30.56 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  29.45 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  30.47 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  28.93 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  29.71 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  30.7 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  30.93 
 
 		 444 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  30.47 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  30.68 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  28.67 
 
 		 452 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  29.25 
 
 		 447 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  32.21 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  30.09 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  30.09 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  30.09 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  31.64 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  30.09 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  31.95 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  30.07 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  30.68 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  29.66 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  28.54 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  30.91 
 
 		 444 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  29.27 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  31.28 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  29.25 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  30.71 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  32.26 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  31.28 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  28.8 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  29.52 
 
 		 441 aa  147  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  30.25 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  28.67 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  31.21 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  30.39 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  30.68 
 
 		 416 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  27.15 
 
 		 423 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  28.57 
 
 		 445 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  28.05 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  29.01 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  29.01 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  31.58 
 
 		 422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  30.8 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  30.8 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  27.85 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  30.18 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  31.25 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  30.09 
 
 		 418 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  31.47 
 
 		 421 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  29.4 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  28.14 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  30.73 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  31.47 
 
 		 421 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  28.54 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  28.96 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  31.29 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  30.65 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  32.87 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  28.9 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  28.67 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  27.27 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  27.91 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>