215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1539 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0356  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 480 aa  985    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4433  outer membrane porin  69.79 
 
 		 529 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1248  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 486 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4735  outer membrane porin  81.38 
 
 		 478 aa  787    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  82.33 
 
 		 479 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0120  outer membrane porin  82.11 
 
 		 474 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00350083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2214  OprD family outer membrane porin  96.71 
 
 		 501 aa  915    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.456443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0752  outer membrane porin for cationic amino acids and peptides  62.32 
 
 		 499 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5323  outer membrane porin  80.96 
 
 		 478 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4861  outer membrane porin  81.59 
 
 		 478 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.054091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5408  outer membrane porin  81.33 
 
 		 490 aa  794    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5537  outer membrane porin  80.96 
 
 		 478 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00176042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1539  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 486 aa  998    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.993831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1729  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 486 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3014  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 527 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0532717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2898  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 527 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.907391  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0390  OprD family outer membrane porin  100 
 
 		 527 aa  1000    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4500  outer membrane porin  68.44 
 
 		 505 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697186  normal  0.197989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4560  outer membrane porin, OprD family  35.36 
 
 		 459 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4237  outer membrane porin  35.03 
 
 		 471 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  35.67 
 
 		 459 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  34.49 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  35.44 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0926  outer membrane porin  33.91 
 
 		 459 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  33.47 
 
 		 484 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  35.01 
 
 		 478 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0814  outer membrane porin  32.89 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657196  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4419  outer membrane porin  35.54 
 
 		 448 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51880  basic amino acid, basic peptide and imipenem outer membrane porin OprD precursor  34.99 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.286241  normal  0.0103947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4550  basic amino acid/basic peptide/imipenem outer membrane porin OprD  35.52 
 
 		 441 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2005  outer membrane porin  33.16 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  33.04 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1400  outer membrane porin  34.17 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  31.92 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2054  outer membrane porin  32.56 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1925  outer membrane porin  32.09 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  34.44 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  31.05 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1367  outer membrane porin  34.27 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  34.51 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  31.12 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  30.89 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  30.89 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  32.5 
 
 		 444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  30 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1171  outer membrane porin  31.18 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00378662  normal  0.540471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2214  outer membrane porin  31.02 
 
 		 440 aa  170  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0154417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32270  putative porin  30.63 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0268  putative porin  30.79 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0224  outer membrane porin  31.15 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.79572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  30.52 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3977  putative porin  30.94 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29220  putative porin  31.3 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.655739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43830  OprD family outer membrane porin  31.96 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5160  outer membrane porin  30.75 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5250  porin, putative  31.15 
 
 		 420 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0046  porin, putative  29.84 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2708  outer membrane porin  30.12 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0060  outer membrane porin  29.84 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  30.34 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0060  outer membrane porin  29.84 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360119  hitchhiker  0.00983666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0063  outer membrane porin  29.84 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02370  putative porin  30.32 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000471352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  32.87 
 
 		 427 aa  156  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4807  outer membrane porin  30.02 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  29.89 
 
 		 447 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3630  porin, putative  29.66 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.563573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  27.91 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  28.3 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  31.62 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0369  outer membrane porin, OprD family  29.14 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3290  outer membrane porin, OprD family  27.63 
 
 		 441 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3618  outer membrane porin  28.87 
 
 		 441 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2754  porin, putative  28.7 
 
 		 479 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2999  outer membrane porin  28.7 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  31.91 
 
 		 421 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  31.91 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0064  outer membrane porin  30.12 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0645144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  29.32 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40060  OprD family outer membrane porin  29.23 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  31.08 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  27.87 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  30.46 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  26.86 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  29.45 
 
 		 416 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  27.31 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  29.36 
 
 		 424 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  28.57 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  26.82 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  28.32 
 
 		 416 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  29.38 
 
 		 415 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  28.19 
 
 		 410 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  28.86 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  26.48 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  28.57 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  29.6 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  29.09 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  28.22 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  27.8 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  29.02 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>