220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0324  putative porin  90.5 
 
 		 416 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02980  putative porin  100 
 
 		 421 aa  850    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  70.63 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4430  outer membrane porin  72.13 
 
 		 418 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1383  BenF-like porin  71.39 
 
 		 418 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.435313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4340  outer membrane porin  71.39 
 
 		 418 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00498222  normal  0.156563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  68.96 
 
 		 417 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  67.96 
 
 		 410 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3451  outer membrane porin  71.17 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2127  outer membrane porin  68.25 
 
 		 418 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1054  outer membrane porin, OprD family  65.73 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2343  outer membrane porin, OprD family  67.87 
 
 		 418 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  68.03 
 
 		 412 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  68.51 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  67.55 
 
 		 412 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  68.51 
 
 		 412 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0903  outer membrane porin  65.96 
 
 		 422 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1277  outer membrane porin  68.26 
 
 		 419 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3077  outer membrane porin  66.11 
 
 		 416 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0293927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26920  OprD family outer membrane porin  65.98 
 
 		 424 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22450  OprD family outer membrane porin  62.65 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38130  OprD family outer membrane porin  65.91 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.764823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00920  OprD family outer membrane porin  62.12 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4527  outer membrane porin  63.78 
 
 		 424 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49300  OprD family outer membrane porin  64.14 
 
 		 428 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.32887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31300  OprD family outer membrane porin  65.99 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17140  outer membrane porin  57.32 
 
 		 405 aa  481  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  55.08 
 
 		 422 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  54.35 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  54.95 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  53.51 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  55.67 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  53.03 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  53.98 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3076  putative porin  51.07 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36090  putative porin  50.83 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000105785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08660  benzoate-specific outer membrane porin  43 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3574  outer membrane porin  44.89 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135647  normal  0.538607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  44.64 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3939  porin, putative  44.14 
 
 		 430 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.38519  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4765  porin  43.51 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0925937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1898  outer membrane porin  43.64 
 
 		 430 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54520  porin  43.77 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0211699  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  43.81 
 
 		 421 aa  325  7e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2681  outer membrane porin  43.51 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.340362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11340  outer membrane porin  42.46 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2547  outer membrane porin  43.27 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3168  benzoate-specific porin  43.27 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143323  normal  0.69398 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2701  outer membrane porin  42.89 
 
 		 416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  41.53 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  41.53 
 
 		 421 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48920  outer membrane porin  42.32 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  42.17 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  42.99 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10440  putative porin  44.02 
 
 		 418 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  42.17 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2103  outer membrane porin  39.95 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  42.42 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0953  putative porin  44.27 
 
 		 418 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2139  outer membrane porin  40.19 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0667606  hitchhiker  0.0000330448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  41.92 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3764  outer membrane porin  39.34 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.522082  normal  0.130801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09850  putative porin  42.36 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.881809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0914  putative porin  41.47 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51070  porin  43.54 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000811517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1999  outer membrane porin  38.88 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  41.01 
 
 		 412 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4356  outer membrane porin  41.69 
 
 		 421 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2632  outer membrane porin  37.53 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17890  putative porin  41.35 
 
 		 416 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  42.86 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  43.1 
 
 		 409 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  39.86 
 
 		 410 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18150  outer membrane porin  38.66 
 
 		 411 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  40.8 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  39.8 
 
 		 410 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  40.15 
 
 		 417 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  39.9 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2074  outer membrane porin  36.85 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1554  putative porin  40.24 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3656  aromatic compound-specific porin, putative  36.15 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.755961  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  39.81 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03800  anaerobically-induced outer membrane porin OprE precursor  38.16 
 
 		 463 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.314855  normal  0.413921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0382  outer membrane porin OprE precursor  37.97 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2946  outer membrane porin, OprD family  37.71 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153867  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  39.06 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3160  outer membrane porin  37.79 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1987  outer membrane porin  35.99 
 
 		 430 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.6739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  36.19 
 
 		 424 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  36.58 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  39.23 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  36.28 
 
 		 440 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  36.34 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  35.66 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  37.35 
 
 		 417 aa  245  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21290  OprE-like outer membrane porin  37.5 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25950  OprE-like outer membrane porin  36.97 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.249173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  36.65 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  36.9 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31180  OprE-like outer membrane porin  36.38 
 
 		 439 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>