137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0731 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  98.5 
 
 		 1147 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  94.05 
 
 		 1164 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0731  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  872    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00636077  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  98.81 
 
 		 1167 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  98.57 
 
 		 1167 aa  739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  98.57 
 
 		 1167 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  98.81 
 
 		 1167 aa  741    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  98.32 
 
 		 1104 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  31.59 
 
 		 1164 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  31.59 
 
 		 1164 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.33 
 
 		 1212 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  28.5 
 
 		 1211 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  29.94 
 
 		 1302 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  30.52 
 
 		 1302 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  31.19 
 
 		 1302 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  31.19 
 
 		 1302 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1205 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1181 aa  106  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  25.53 
 
 		 1171 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  24.01 
 
 		 1172 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1176 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  23.87 
 
 		 1207 aa  100  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1208 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  25.06 
 
 		 1157 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  26.26 
 
 		 1164 aa  96.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  28.17 
 
 		 1152 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  27.7 
 
 		 1302 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  30.56 
 
 		 1302 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  24.62 
 
 		 1209 aa  93.2  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  25.45 
 
 		 1209 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1328 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1150 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  28.37 
 
 		 1209 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25.06 
 
 		 1218 aa  89  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  26.55 
 
 		 1289 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  26.55 
 
 		 1289 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  26.55 
 
 		 1289 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2040  hypothetical protein  29.7 
 
 		 1334 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0549  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1299 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  26.84 
 
 		 1289 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  26.27 
 
 		 1199 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  26.44 
 
 		 1268 aa  86.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1525 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1355 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1322 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1319 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1192 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  25.69 
 
 		 1165 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  27.36 
 
 		 1179 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.5 
 
 		 1187 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  26.22 
 
 		 1165 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1175 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1175 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1179 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  25.19 
 
 		 1176 aa  81.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1208 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 1177 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  26.82 
 
 		 1177 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  25 
 
 		 1102 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1206 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  24.18 
 
 		 1182 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  25.88 
 
 		 1165 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0855  putative lipoprotein  28.81 
 
 		 1296 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0883646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  27.9 
 
 		 1220 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  28.41 
 
 		 1329 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  28.79 
 
 		 1206 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  22.16 
 
 		 1182 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1315 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  28.31 
 
 		 1268 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  23.3 
 
 		 830 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  24.53 
 
 		 830 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1267 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1195 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  30.61 
 
 		 1265 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  24.41 
 
 		 1314 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  24.41 
 
 		 1314 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  24.41 
 
 		 1314 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1174 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  24.23 
 
 		 1288 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  24.41 
 
 		 1313 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  31.93 
 
 		 1267 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  24.41 
 
 		 1313 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1297 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  28.24 
 
 		 1194 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  24.41 
 
 		 1301 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 1194 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1154 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1174 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>