262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3840 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3840  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  346  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143531  hitchhiker  0.000000000101512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1505  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  346  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1332  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  96.47 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1331  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  96.47 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1468  transcriptional regulator  96.47 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1541  putative transcriptional regulator  96.47 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000185987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1358  transcriptional regulator  95.88 
 
 		 175 aa  335  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1572  transcriptional regulator, putative  95.29 
 
 		 170 aa  333  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1611  putative transcriptional regulator  95.29 
 
 		 170 aa  333  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000274879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1373  cyclic nucleotide-binding protein  93.53 
 
 		 170 aa  330  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1175  cyclic nucleotide-binding protein  86.47 
 
 		 170 aa  313  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.787015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.31 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.74 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.74 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.3 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.34 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.54 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.34 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.7 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 		 226 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.47 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.88 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1987  regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases-like  26.79 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.99 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.75 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.51 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.18 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.04 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.94 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.98 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  28.24 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.44 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.31 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.03 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.74 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  25.29 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  24.12 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.98 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.94 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  25.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  22.62 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.73 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.62 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.84 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 243 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.95 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 		 228 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  26.51 
 
 		 239 aa  52  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 226 aa  51.6  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5575  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.07 
 
 		 254 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00404309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 198 aa  50.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 225 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 246 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  26.22 
 
 		 211 aa  50.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 263 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2161  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.776076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  25.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  25.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  25.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  25.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  25.61 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.77 
 
 		 239 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  25.3 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>