289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1175 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1175  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
170 aa  345  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.787015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1332  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1331  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1468  transcriptional regulator  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1541  putative transcriptional regulator  87.65 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000185987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1358  transcriptional regulator  87.06 
 
 
175 aa  316  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1611  putative transcriptional regulator  86.47 
 
 
170 aa  313  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000274879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3840  putative transcriptional regulator  86.47 
 
 
170 aa  313  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143531  hitchhiker  0.000000000101512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1505  putative transcriptional regulator  86.47 
 
 
170 aa  313  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1373  cyclic nucleotide-binding protein  86.47 
 
 
170 aa  313  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1572  transcriptional regulator, putative  85.29 
 
 
170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 
225 aa  77.8  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.52 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.93 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.52 
 
 
225 aa  71.2  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.74 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.4 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.34 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.74 
 
 
226 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.14 
 
 
225 aa  67.4  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.93 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
225 aa  67  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.74 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.71 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.94 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
236 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.27 
 
 
225 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  25.45 
 
 
225 aa  62  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
228 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 
354 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.74 
 
 
224 aa  61.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 
219 aa  60.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.54 
 
 
225 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.34 
 
 
225 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
225 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
229 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.03 
 
 
225 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
244 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.28 
 
 
226 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  24.28 
 
 
226 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
232 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.24 
 
 
224 aa  57.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 
226 aa  57.4  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  28.24 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
219 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 
224 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.7 
 
 
224 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1987  regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases-like  25.58 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.38 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  32.93 
 
 
225 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
231 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  28.24 
 
 
222 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
225 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
231 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
231 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
226 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
237 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.01 
 
 
228 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.48 
 
 
223 aa  54.3  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
237 aa  53.9  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 
226 aa  53.9  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 
235 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
252 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
224 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
224 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 
227 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.89 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.47 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  23.93 
 
 
232 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.08 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
241 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
230 aa  52.4  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
232 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.22 
 
 
251 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  26.13 
 
 
232 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
237 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25.29 
 
 
239 aa  51.6  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 
229 aa  51.6  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0691  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.58 
 
 
214 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.275069  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
224 aa  50.8  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
224 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>