239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1572 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1572  transcriptional regulator, putative  100 
 
 
170 aa  348  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1332  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  97.65 
 
 
170 aa  342  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1331  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  97.65 
 
 
170 aa  342  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1468  transcriptional regulator  97.65 
 
 
170 aa  342  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1611  putative transcriptional regulator  97.65 
 
 
170 aa  342  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000274879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1541  putative transcriptional regulator  97.65 
 
 
170 aa  342  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000185987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1358  transcriptional regulator  97.06 
 
 
175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1373  cyclic nucleotide-binding protein  94.71 
 
 
170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1505  putative transcriptional regulator  95.29 
 
 
170 aa  333  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3840  putative transcriptional regulator  95.29 
 
 
170 aa  333  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143531  hitchhiker  0.000000000101512 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1175  cyclic nucleotide-binding protein  85.29 
 
 
170 aa  311  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.787015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.74 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.34 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.05 
 
 
225 aa  67.8  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 
225 aa  67.4  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.7 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.74 
 
 
226 aa  64.3  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.09 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
228 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.22 
 
 
220 aa  62.4  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.95 
 
 
228 aa  61.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
228 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
226 aa  61.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.38 
 
 
236 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
242 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
226 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 
229 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.47 
 
 
225 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.88 
 
 
225 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 
354 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 
222 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.62 
 
 
226 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.38 
 
 
237 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.74 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.71 
 
 
236 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.6 
 
 
219 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1987  regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases-like  28.4 
 
 
236 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
224 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.18 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  22.62 
 
 
226 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.51 
 
 
226 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  27.65 
 
 
222 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
244 aa  53.9  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
239 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
222 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.85 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.89 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.44 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 
243 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
226 aa  52.4  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
252 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.94 
 
 
229 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  24.12 
 
 
232 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 
224 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
231 aa  52  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  25.29 
 
 
232 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
231 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.74 
 
 
225 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.56 
 
 
235 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.26 
 
 
226 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.62 
 
 
251 aa  51.2  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25.3 
 
 
239 aa  51.2  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  28.24 
 
 
224 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
225 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 
228 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 
223 aa  50.8  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.54 
 
 
224 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.39 
 
 
236 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.62 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.07 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.15 
 
 
243 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5575  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00404309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.26 
 
 
230 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1849  cyclic nucleotide-binding  21.09 
 
 
195 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00134256  normal  0.103049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.32 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
263 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
246 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
241 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  24.7 
 
 
211 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
232 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
198 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
225 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  24.12 
 
 
223 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.14 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 
235 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
252 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.38 
 
 
229 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
223 aa  47.8  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
231 aa  47.8  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>