226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1611 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A1611  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  349  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000274879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1332  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  98.82 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1331  cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit  98.82 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1468  transcriptional regulator  98.82 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1541  putative transcriptional regulator  98.82 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000185987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1358  transcriptional regulator  98.24 
 
 		 175 aa  343  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1572  transcriptional regulator, putative  97.65 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1373  cyclic nucleotide-binding protein  94.71 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3840  putative transcriptional regulator  95.29 
 
 		 170 aa  333  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143531  hitchhiker  0.000000000101512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1505  putative transcriptional regulator  95.29 
 
 		 170 aa  333  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1175  cyclic nucleotide-binding protein  86.47 
 
 		 170 aa  313  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.787015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.14 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.44 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.09 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.71 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.48 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0424  transcriptional regulator, Crp family  26.47 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4894  transcriptional regulator, Crp family  26.47 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770605  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.88 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.35 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.67 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.15 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.68 
 
 		 225 aa  57.4  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.16 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.19 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.38 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.95 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.71 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.59 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1987  regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases-like  25.6 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  22.02 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  27.65 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.9 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.17 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 239 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 252 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.54 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 231 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.74 
 
 		 235 aa  50.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.62 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.29 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.34 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25.9 
 
 		 239 aa  49.3  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.65 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  23.53 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  24.71 
 
 		 232 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5575  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.41 
 
 		 254 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00404309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.45 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.78 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 248 aa  48.5  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 252 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 243 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0880  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.45 
 
 		 219 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.812688  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  24.85 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 246 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.25 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 263 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.13 
 
 		 223 aa  47.8  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 232 aa  47.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 224 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  24.12 
 
 		 223 aa  47.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.54 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 232 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1849  cyclic nucleotide-binding  20.41 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00134256  normal  0.103049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.71 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>