More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2161 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2161  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.776076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0352  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
229 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0345  Crp family transcriptional regulator  36.87 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.254354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0411  transcriptional regulator, Crp family  36.87 
 
 
229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000553573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0477  Crp family transcriptional regulator  35.94 
 
 
229 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0933534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4894  transcriptional regulator, Crp family  35.48 
 
 
229 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770605  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0424  transcriptional regulator, Crp family  35.02 
 
 
229 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.48 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.48 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.33 
 
 
233 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  22.6 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  28.36 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.35 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2812  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.53 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  27.41 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.9 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.14 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  23.64 
 
 
352 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.98 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.21 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.65 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.52 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.4 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
214 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  26.26 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  26.47 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  26.87 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  23.11 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 
229 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  22.62 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1971  transcriptional regulator  25.99 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  25.87 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.27 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  25.64 
 
 
217 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  26.37 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.95 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.99 
 
 
226 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.51 
 
 
232 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.02 
 
 
228 aa  58.5  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.77 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 
257 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
229 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.62 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.58 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  25.13 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  27.6 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  26.4 
 
 
210 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
254 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>