158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1821 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1821  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 292 aa  560  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6348  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.8 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.93 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.26 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.22 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.33 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  29.67 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  31.51 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  34.42 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.01 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.25 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  39.19 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.03 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  22.97 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  28.29 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25.65 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.3 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  26.71 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  29.63 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  30.6 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.79 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  25.89 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  25.6 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.49 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  23 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.83 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.18 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.33 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.34 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  25.26 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  23.27 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35643  predicted protein  26.69 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.7036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.09 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  22.67 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.93 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  26.77 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  24.7 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  30.46 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  29.94 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  24.3 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  26.67 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.42 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  24.75 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  25.35 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.76 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  31.13 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  28.23 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  26.29 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1414  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  28.52 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  31.22 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  24.24 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  30.29 
 
 		 323 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 320 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  28.64 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0151  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 327 aa  52.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  29.14 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  25.44 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  29.68 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.61 
 
 		 323 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  31.14 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  25.82 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  25.82 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  26.99 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  24.61 
 
 		 333 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  23.96 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  23.26 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  23.26 
 
 		 325 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  30.84 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  21.65 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.79 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.36 
 
 		 305 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.95 
 
 		 348 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  26.95 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  27.23 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  27.98 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  23.12 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.21 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  28.93 
 
 		 338 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>