216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6348 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6348  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1395  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.83 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.32 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39.07 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3617  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.33 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  39 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1821  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.07 
 
 		 292 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 317 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  33.11 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  38.2 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  33.04 
 
 		 342 aa  92.4  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  27.9 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  28.99 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  29.27 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  25.82 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  28.12 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25.65 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.35 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  34.08 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  27.18 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  29.63 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.84 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  23.43 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.24 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.74 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.71 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  31.27 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  30.99 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  27.47 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  23.32 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  25.44 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.76 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  27.88 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  31.62 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  25.58 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  24.41 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  27.16 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.48 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  27.56 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  29.19 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  29.48 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.44 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  25.72 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  29.21 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.12 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  26.3 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.47 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  26.55 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  25.17 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  31.69 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  27.65 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  26.63 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  26.91 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  26.61 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  26.61 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  28.24 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  26.61 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.67 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  26.34 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  28.71 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  26.91 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  25.74 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  25.74 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  24.57 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  25.42 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  29.33 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  27.42 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  27.23 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  27.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.55 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.81 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.18 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  24.23 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  24.16 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  28.27 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  25.52 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  27.7 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  29.76 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  27.02 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  30.29 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  26.21 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  27.62 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  19.53 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>