78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1476 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.736982 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  99.61 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2809  putative bacteriophage tail fiber protein  96.15 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  58.58 
 
 		 166 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  45.52 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  55.84 
 
 		 340 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  58.6 
 
 		 682 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  54.8 
 
 		 646 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  57.42 
 
 		 689 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  52.98 
 
 		 621 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  51.48 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  48.26 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  48.26 
 
 		 179 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  51.19 
 
 		 176 aa  144  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  51.27 
 
 		 557 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  47.75 
 
 		 401 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  50.59 
 
 		 498 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  50 
 
 		 485 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  48.45 
 
 		 371 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2097  Tail Collar domain protein  44.44 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  45.16 
 
 		 402 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3111  hypothetical protein  57.94 
 
 		 363 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.972447  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1817  Tail Collar domain protein  45 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0634  shufflon domain protein  45.28 
 
 		 532 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0635  Tail Collar domain protein  44.67 
 
 		 140 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0451681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0638  Tail Collar domain protein  46.54 
 
 		 157 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.437833  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0637  Tail Collar domain protein  43.42 
 
 		 140 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.436358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0298  putative tail fiber protein  38.03 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.991261  normal  0.467938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1062  Tail Collar domain protein  41.61 
 
 		 530 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  58.21 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1451  hypothetical protein  57.89 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0220667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0636  Tail Collar domain protein  35.1 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.266713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  47.95 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  47.95 
 
 		 1120 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  47.95 
 
 		 1137 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  47.22 
 
 		 516 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  39.39 
 
 		 962 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  47.95 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  47.22 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  45.95 
 
 		 1007 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  46.58 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1692  hypothetical protein  32.62 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.705113  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  32 
 
 		 817 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  32.8 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0745  hypothetical protein  32.11 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.106262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  35.71 
 
 		 554 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  30.69 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  29.95 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  29.41 
 
 		 790 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  34.21 
 
 		 805 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  49.28 
 
 		 483 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  42.11 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2582  hypothetical protein  42.27 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0551866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  33.04 
 
 		 791 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1141  tail fiber domain-containing protein  31.11 
 
 		 527 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3092  hypothetical protein  27.12 
 
 		 472 aa  52.4  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.715953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5071  putative tail fiber protein  37.66 
 
 		 654 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0685  putative tail fiber protein  37.66 
 
 		 654 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1333  phage-related tail fiber protein  36.63 
 
 		 790 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1868  hypothetical protein  40 
 
 		 290 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  hitchhiker  0.000000000000451557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  27.33 
 
 		 671 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1862  phage tail collar domain-containing protein  38.46 
 
 		 735 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4853  hypothetical protein  35.63 
 
 		 536 aa  48.5  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  34.45 
 
 		 519 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  36.49 
 
 		 492 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1106  Tail Collar domain protein  34.04 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3044  hypothetical protein  39.29 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000867038  hitchhiker  0.0000222782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1164  hypothetical protein  35.48 
 
 		 383 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0751  hypothetical protein  31.25 
 
 		 430 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1168  tail fiber protein, putative  38.18 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1166  hypothetical protein  30.61 
 
 		 364 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3858  tail fiber protein, putative  38.57 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.642523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2015  hypothetical protein  39.58 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  32.88 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  33.33 
 
 		 469 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1170  carbohydrate-binding, CenC-like  33.93 
 
 		 400 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0183  tail fiber repeat 2-containing protein  34.92 
 
 		 408 aa  42.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1303  hypothetical protein  38.2 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.616421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>