95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0106 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  95.63 
 
 		 361 aa  683    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  95.9 
 
 		 357 aa  695    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  100 
 
 		 366 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  77.98 
 
 		 339 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  76.42 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  73.11 
 
 		 338 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  70 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  70.2 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  70.2 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  69.81 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  70.2 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  69.81 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  69.81 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  69.81 
 
 		 337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  70.2 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  70.2 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  73.29 
 
 		 328 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  68.42 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  69.61 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  69.61 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  69.61 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  69.61 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  69.61 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  41.72 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  39.08 
 
 		 339 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  38.87 
 
 		 366 aa  200  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  37.46 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  37.46 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  35.79 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  34.59 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  35.44 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  32.27 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  33.56 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.85 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13368  integral membrane protein  34.4 
 
 		 289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  30.71 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  32.8 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  32.43 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  26.71 
 
 		 311 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  29.47 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0898  ribonuclease BN  26.33 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0551761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  25.33 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  24.84 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2530  ribonuclease BN  24.56 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0653  ribonuclease BN  26.11 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  22.31 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  23.38 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  21.91 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  22.58 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  22.18 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  22.26 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  23.51 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0341  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0362  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0352  ribonuclease BN  25.89 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.062974  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1997  ribonuclease BN  25.38 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  25.88 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4548  ribonuclease BN  22.11 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5550  membrane protein-like protein  27.94 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  22.87 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  23.96 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  24.62 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  24.12 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  25.59 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1654  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 345 aa  49.7  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00658785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  26.16 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  23.34 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  26.32 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  27.84 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2480  putative ribonuclease BN  27.53 
 
 		 546 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20430  predicted membrane protein  22.26 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0112406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  21.18 
 
 		 291 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  21.81 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  20.45 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  22.38 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  30 
 
 		 446 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  20.97 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  22.38 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  25.14 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  23.34 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  24.69 
 
 		 538 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  29.21 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 307 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2776  putative ribonuclease BN  23.39 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  23.08 
 
 		 442 aa  43.1  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  24.82 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.89 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02750  YihY family protein  22.01 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 350 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>